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heibeidedong木虫 (正式写手)
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关于boundary command
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一直对boundary command没有搞清楚,p,f,s,m这些模拟盒子的边界对即将在盒子中建立的原子有何影响,还有就是我试验了一下,建一个金刚石单胞,为什么以 p p p为边界条件 和以p p m 为边界条件的模拟盒子的尺寸不一样, p p p模拟盒子中有8个原子坐标,而p p m中有10个原子坐标,为什么?下面是两个dump文件的一部分(1) ITEM: TIMESTEP 0 ITEM: NUMBER OF ATOMS 8 ITEM: BOX BOUNDS pp pp pp 0 3.567 0 3.567 0 3.567 ITEM: ATOMS id type x y z 1 1 0 0 0 2 1 0 1.7835 1.7835 3 1 1.7835 0 1.7835 4 1 1.7835 1.7835 0 5 1 0.89175 0.89175 0.89175 6 1 0.89175 2.67525 2.67525 7 1 2.67525 0.89175 2.67525 8 1 2.67525 2.67525 0.89175 (2)ITEM: TIMESTEP 0 ITEM: NUMBER OF ATOMS 10 ITEM: BOX BOUNDS pp pp ss 0 3.567 0 3.567 -0.0003567 3.56736 ITEM: ATOMS id type x y z 1 1 0 0 0 2 1 0 1.7835 1.7835 3 1 1.7835 0 1.7835 4 1 1.7835 1.7835 0 5 1 0.89175 0.89175 0.89175 6 1 0.89175 2.67525 2.67525 7 1 2.67525 0.89175 2.67525 8 1 2.67525 2.67525 0.89175 9 1 0 0 3.567 10 1 1.7835 1.7835 3.567 |
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ddll_slsl
木虫 (正式写手)
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