24小时热门版块排行榜    

查看: 876  |  回复: 1

heibeidedong

木虫 (正式写手)

[求助] 关于boundary command

一直对boundary command没有搞清楚,p,f,s,m这些模拟盒子的边界对即将在盒子中建立的原子有何影响,还有就是我试验了一下,建一个金刚石单胞,为什么以 p p p为边界条件 和以p p m 为边界条件的模拟盒子的尺寸不一样, p p p模拟盒子中有8个原子坐标,而p p m中有10个原子坐标,为什么?下面是两个dump文件的一部分(1)
ITEM: TIMESTEP
0
ITEM: NUMBER OF ATOMS
8
ITEM: BOX BOUNDS pp pp pp
0 3.567
0 3.567
0 3.567
ITEM: ATOMS id type x y z
1 1 0 0 0
2 1 0 1.7835 1.7835
3 1 1.7835 0 1.7835
4 1 1.7835 1.7835 0
5 1 0.89175 0.89175 0.89175
6 1 0.89175 2.67525 2.67525
7 1 2.67525 0.89175 2.67525
8 1 2.67525 2.67525 0.89175


(2)ITEM: TIMESTEP
0
ITEM: NUMBER OF ATOMS
10
ITEM: BOX BOUNDS pp pp ss
0 3.567
0 3.567
-0.0003567 3.56736
ITEM: ATOMS id type x y z
1 1 0 0 0
2 1 0 1.7835 1.7835
3 1 1.7835 0 1.7835
4 1 1.7835 1.7835 0
5 1 0.89175 0.89175 0.89175
6 1 0.89175 2.67525 2.67525
7 1 2.67525 0.89175 2.67525
8 1 2.67525 2.67525 0.89175
9 1 0 0 3.567
10 1 1.7835 1.7835 3.567
回复此楼
努力提高和完善自己
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
heibeidedong: 金币+5, 有帮助 2013-04-21 23:14:52
边界条件会影响原子的重复位置,结构不一样很正常。 但如果把其周期性展开, 就清楚了。 LZ需要多琢磨。
2楼2013-04-21 18:34:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 heibeidedong 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:50 by hZiFeudZyoGR
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:40 by hZiFeudZyoGR
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 11/550 2026-08-30 17:34 by hZiFeudZyoGR
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 10/500 2026-08-30 17:33 by hZiFeudZyoGR
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 14/700 2026-08-30 17:01 by hZiFeudZyoGR
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 14:05 by GkCVyODlx4mR
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 13:54 by GkCVyODlx4mR
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 6/300 2026-08-30 13:54 by GkCVyODlx4mR
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +6 德尚中行 2026-08-27 7/350 2026-08-30 12:53 by Bxndjjd
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +8 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:40 by l0VvVHGBGRLv
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:19 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国社科申报系统有变化 +3 kynobel 2026-08-23 3/150 2026-08-29 21:57 by 余韵清
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
信息提示
请填处理意见