应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 序列对比
131/2返回列表12下一页
查看: 1110  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

追风舞尘

铁虫 (初入文坛)

[求助] 序列对比

各位，大家好啊
我通过分子标记得出了一种植物雌雄的差异条带，已经测序了，现在有这种植物的转录组测序结果，是fa格式的，我想比对下，这些差异序列，在转录组中有没有相似的，请问用什么方法，什么软件？我之前用DNAman比对，可是根本不行，软件带不起来，转录组的测序结果有三千多万bp。
谢谢各位！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2013-04-15 20:56:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

hpzinc65

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
追风舞尘: 金币+4, ★★★★★最佳答案, 正解！ 2013-04-16 13:35:37
Bio-Edit 把转录组的序列导入，然后本地blast
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2013-04-16 11:16:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

追风舞尘

铁虫 (初入文坛)
有没有人做这一块啊？
赞一下 回复此楼
2楼2013-04-16 08:08:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aoda123

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
DNAstar很好用啊
赞一下 回复此楼
身体健康，工作顺利
3楼2013-04-16 08:12:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊。快乐每一天 2013-04-16 11:10:57
那就跑本地端的blast吧，还是不行就换linux端跑
赞一下 回复此楼
4楼2013-04-16 09:01:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

追风舞尘

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by aoda123 at 2013-04-16 08:12:35
DNAstar很好用啊

我的转录组信息文件是fa格式的，DNAstar好像识别不了，文件有30M，三千多万的序列，DNAman运行就无法反应，clustal可以识别，但是要把这三千多万序列全部都分别对比，时间太长···
赞一下 回复此楼
5楼2013-04-16 10:19:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

追风舞尘

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-04-16 09:01:16
那就跑本地端的blast吧，还是不行就换linux端跑

本地端blast我还没试过，不过我在NCBI上面做了在线的查询，一直不出结果，或者网页无法显示
赞一下 回复此楼
6楼2013-04-16 10:22:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
追风舞尘(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊。快乐每一天 2013-04-16 11:07:15
内容已删除
赞一下 回复此楼
7楼2013-04-16 10:41:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

追风舞尘

铁虫 (初入文坛)
内容已删除
回复此楼
9楼2013-04-16 13:33:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

追风舞尘

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by hpzinc65 at 2013-04-16 11:16:55
Bio-Edit 把转录组的序列导入，然后本地blast

大神啊！这么简单就出来了！我搜了整整一天，下了Ｎ多软件，上了无限个在线ｂｌａｓｔ，都因为文件太大，无法完成！ｂｉｏ－ｅｄｉｔ救了我一命！！！
赞一下 回复此楼
10楼2013-04-16 13:35:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 追风舞尘 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +5 生物工程调剂 2026-03-17 9/450 2026-03-21 23:32 by zhujy1982
[考研] 一志愿北京化工大学070300 学硕336求调剂 +3 vv迷 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:05 by f19980501
[考研] 求助 +5 梦里的无言 2026-03-21 6/300 2026-03-21 17:51 by 学员8dgXkO
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 313求调剂 +4 肆叁贰壹22 2026-03-19 4/200 2026-03-21 17:33 by ColorlessPI
[考研] 265求调剂 +9 梁梁校校 2026-03-17 9/450 2026-03-21 02:17 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +9 Doleres 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:36 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 一志愿中南化学（0703）总分337求调剂 +8 niko- 2026-03-19 9/450 2026-03-20 21:57 by luoyongfeng
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中农业071010，总分320求调剂 +3 困困困困坤坤 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:38 by 学员8dgXkO
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考博] 招收博士1-2人 +3 QGZDSYS 2026-03-18 3/150 2026-03-20 11:58 by 呱呱呱呱叫
[考研] 求调剂 +3 暗涌afhb 2026-03-16 3/150 2026-03-20 00:28 by 河南大学校友
[考研] 一志愿中国海洋大学，生物学，301分，求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 6/300 2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考研] 085600材料与化工调剂 324分 +10 llllkkkhh 2026-03-18 12/600 2026-03-19 14:33 by llllkkkhh
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭