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zhanghh1127

金虫 (正式写手)

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[求助] ML法建树的源文件

希望得到一个ML法构建系统发育树的源文件*.nxs在不考虑模型的情况下可以直接拿来在PAUP里面运行得到结果的
运行有结果的可以再发金币
还希望各位建树方面的前辈帮帮忙我找到的命令是：
Begin Paup;
log file=ML.log;
Set criterion=likelihood;
Lset Base=(0.3413 0.2847 0.0895)
Nst=6 Rmat=(0.3885 3.5246 0.5305 0.4364 3.2970)
Rates=gamma Shape=0.5232 Pinvar=0.2613;
Hsearch start=nj nchuck=2 chuckscore=5 dstatus=none;
savetrees format=nexus brlens=yes append=yes file=likelihood;
lscores 1/scorefile=likelihood.sf append=yes;
set root=outgroup;
outgroup 27 28;
showtrees all;
log stop;
end;
但是这个命令得到的结果，我找不到支持率跟步长值

[ Last edited by zhanghh1127 on 2013-4-17 at 12:19 ]

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