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zhanghh1127金虫 (正式写手)
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[求助]
ML法建树的源文件
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希望得到一个ML法构建系统发育树的源文件*.nxs在不考虑模型的情况下可以直接拿来在PAUP里面运行得到结果的 运行有结果的可以再发金币 还希望各位建树方面的前辈帮帮忙 我找到的命令是： Begin Paup; log file=ML.log; Set criterion=likelihood; Lset Base=(0.3413 0.2847 0.0895) Nst=6 Rmat=(0.3885 3.5246 0.5305 0.4364 3.2970) Rates=gamma Shape=0.5232 Pinvar=0.2613; Hsearch start=nj nchuck=2 chuckscore=5 dstatus=none; savetrees format=nexus brlens=yes append=yes file=likelihood; lscores 1/scorefile=likelihood.sf append=yes; set root=outgroup; outgroup 27 28; showtrees all; log stop; end; 但是这个命令得到的结果，我找不到支持率跟步长值 [ Last edited by zhanghh1127 on 2013-4-17 at 12:19 ] |
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