24小时热门版块排行榜    

查看: 1655  |  回复: 22
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xjtu0025

新虫 (小有名气)

[求助] 一步RT-PRC后样品卡在凝胶孔了

提细胞总RNA,跑出三条带了,第一条比第二条亮一倍多。
然后RT-PCR用特异性引物做,阳性对照,阴性对照,实验组都没有东西,marker出来了。那三组凝胶孔发亮。
我加的模板是3微,由于没机会测浓度和OD260/280,第一次做的时候加了5微,也是一样的效果。
由于引物除了互补区外还加了酶切位点和保护碱基,就逆转录过后5个循环是不算酶切位点的退火温度,剩下做了25个循环是按照全长引物算的,大概提高了7度。
由于内参也没有做出来,我很是抑郁。
想知道,是不是就是因为我没有测纯度和浓度造成的。但是我跑总RNA的时候条带除了28s的两侧有一点拖尾,另外两条都很好,亮度也不错。

PS,如果我引物不是完全互补的,是不是会造成PCR的难度捏。那我是不是应该用两步RTPCR比较好?

拜托大神们了!

rtpcr.jpg



总RNA.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xjtu0025

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by mitocam at 2013-04-07 01:08:04
检查一下RNA有没有降解了或RT PCR产物,多试几个手头现有的RT-PCR阳性参照。

那个RT-PCR的时候就已经加好了溴酚蓝了,然后放进机器里面再拿出来蓝色就会再底部沉淀,这样有没有影响呢,我上样品的时候要用枪吹匀才行
4楼2013-04-07 10:13:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 23 个回答

emosgaogao

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 鼓励应助,分子生物版块,期待你的精彩。 2013-04-07 11:52:25
楼主PCR后的样品可能是蛋白质污染,目的片段的丰度低,而且从总RNA的电泳结果看28s片段有拖尾,所以还是建议楼主试试2步法RT-PCR看。
忍得住诱惑,耐得住寂寞
2楼2013-04-07 00:04:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mitocam

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 鼓励应助,分子生物版块,期待你的精彩。 2013-04-07 11:52:35
检查一下RNA有没有降解了或RT PCR产物,多试几个手头现有的RT-PCR阳性参照。
3楼2013-04-07 01:08:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xjtu0025

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by emosgaogao at 2013-04-07 00:04:14
楼主PCR后的样品可能是蛋白质污染,目的片段的丰度低,而且从总RNA的电泳结果看28s片段有拖尾,所以还是建议楼主试试2步法RT-PCR看。

你是说PCR之后蛋白污染了?还是总RNA提取的时候蛋白污染了,我用的是trizol法,那个吹打过程要多久呢,我一般就吹个1分钟.我用培养瓶细胞的.
5楼2013-04-07 10:14:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 9/450 2026-08-23 10:59 by Tide man
[基金申请] 什么时候开奖? +8 CrisMessi 2026-08-18 9/450 2026-08-23 10:49 by 旋风马1987
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 10/500 2026-08-23 07:17 by OEbVnUOu01ol
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 5/250 2026-08-23 04:07 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 zjuhero 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见