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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » Polyrate计算速率常数的结果与实际差的数量级太多，怎么办？
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datouwa

木虫 (小有名气)

[求助] Polyrate计算速率常数的结果与实际差的数量级太多，怎么办？

请各位POLYRATE高手帮忙我看看，我的问题出在哪，谢谢！
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    • 2013-04-05 21:54:56, 1.12 M

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1楼 2013-04-05 21:58:11
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sduzhaoyyang

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yongleli at 2013-04-06 09:28:01
另，polyrate的默认参数一般都是不好使的
需要针对具体的体系调。

所以，别看它计算速度快，
一般调参数要调个一周左右。
建议你建立一个Excell文档，列出每种可能的参数，
然后一遍一遍地run，直到结果跟实 ...

这样有什么意义，是人为使理论值接近实验值。
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5楼2013-04-27 10:53:10
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
datouwa: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢你的回复！我再好好调一下参数！ 2013-04-07 19:53:27
1.仔细看文献，有没有用跟文献一样的关键字。

2.调各种参数，直到计算结果收敛。

3.polyrate虽然是Truhlar组里搞出来的，
用polyrate的达人却是这个西班牙佬:
Espinosa-Garcia
多看看他的文章。
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2楼2013-04-06 09:25:31
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
datouwa: 金币+10, ★★★很有帮助, Thank you very much! 2013-04-07 19:54:01
另，polyrate的默认参数一般都是不好使的
需要针对具体的体系调。

所以，别看它计算速度快，
一般调参数要调个一周左右。
建议你建立一个Excell文档，列出每种可能的参数，
然后一遍一遍地run，直到结果跟实验值符合为止。

有时候还需要scale掉TS的频率。请参考Jingzhi Pu跟Truhlar合写的文章。
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3楼2013-04-06 09:28:01
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sduzhaoyyang

银虫 (正式写手)
主要是势垒影响速率，势垒的误差是由方法造成的。如果误差是有方法体系造成的，这个是难免的。
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4楼2013-04-27 10:51:13
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