【答案】应助回帖

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2013-04-05 21:54:56, 1.12 M

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1楼2013-04-05 21:58:11

yongleli

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
datouwa: 金币+10, ★★★很有帮助, Thank you very much! 2013-04-07 19:54:01

另，polyrate的默认参数一般都是不好使的
需要针对具体的体系调。

所以，别看它计算速度快，
一般调参数要调个一周左右。
建议你建立一个Excell文档，列出每种可能的参数，
然后一遍一遍地run，直到结果跟实验值符合为止。

有时候还需要scale掉TS的频率。请参考Jingzhi Pu跟Truhlar合写的文章。

3楼2013-04-06 09:28:01

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yongleli

木虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
datouwa: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢你的回复！我再好好调一下参数！ 2013-04-07 19:53:27

1.仔细看文献，有没有用跟文献一样的关键字。

2.调各种参数，直到计算结果收敛。

3.polyrate虽然是Truhlar组里搞出来的，
用polyrate的达人却是这个西班牙佬:
Espinosa-Garcia
多看看他的文章。

2楼2013-04-06 09:25:31

sduzhaoyyang

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主要是势垒影响速率，势垒的误差是由方法造成的。如果误差是有方法体系造成的，这个是难免的。

4楼2013-04-27 10:51:13

sduzhaoyyang

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引用回帖:

3楼: Originally posted by yongleli at 2013-04-06 09:28:01
另，polyrate的默认参数一般都是不好使的
需要针对具体的体系调。

所以，别看它计算速度快，
一般调参数要调个一周左右。
建议你建立一个Excell文档，列出每种可能的参数，
然后一遍一遍地run，直到结果跟实 ...

这样有什么意义，是人为使理论值接近实验值。

5楼2013-04-27 10:53:10