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huyingdamon

银虫 (小有名气)


[求助] 求助大家

gromacs手册貌似看不懂啊,可能刚看会很吃力,我想请教一下我是不是需要把里面的内容基本都弄懂呢,还是大致看下就行,还有看到温度耦合和压力耦合,还是不知道什么意思到底。希望大家帮帮我,谢谢哈……
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2013-04-03 08:35:14
huyingdamon: 金币+2, 很感谢 2013-04-08 23:34:06
刚入门的话,你需要先按照教程走一遍,弄懂gromacs模拟的过程是怎么样的,网上还有一个 “GROMACS Introductory Tutorial ”不错;
还有“GROMACS_MD_Flowchart.pdf” 和“File Format In Gromacs.pdf” 这三个资料都不错。

这三个网上的资料,找到,并且看完,那个教程做一遍,在做的同时,你需要结合手册搞懂各个命令的意义,用法,同时思考如果是你需要做自己的模拟的时候,你如何来建立自己的模型,如何修改各个参数。

PS,网上还有各位热心人自己总结的心得体会,也可以好好理解理解
3楼2013-04-03 08:26:50
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wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-04-03 08:20:31
huyingdamon: 金币+1, 谢谢了 2013-04-08 23:33:33
如果只是想开始进行计算模拟的话,没有太大的必要把精力都投入到看手册上。手册可以当成一个工具书,在有问题的时候去翻一翻,通过这种方式把问题解决了,个人感觉比光看手册能好点。如果说想要彻底把GROMACS弄懂的话就另当别论了。
努力的生活着
2楼2013-04-02 20:56:43
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