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huangpu2009

铁虫 (小有名气)

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[求助] Siesta 3.1编译出错，按照张老师的视频进行的，麻烦大家帮帮忙，谢谢。

刚开始学，按照老师的视频编译时，
最后报错，cannot find -lmkl_solver
看了下lib文件夹下面，好像没这个文件呀，我用的是intel_parallel_xe_2013版的。
求教一下，谢谢~~~~

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1楼2013-04-02 15:00:02

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖！ 2013-04-02 22:17:51
huangpu2009: 金币+1, ★有帮助, 谢谢，我再试一下。 2013-04-03 12:42:05

#
# This file is part of the SIESTA package.
#
# Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid:
# E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal
# and J.M.Soler, 1996- .
#
# Use of this software constitutes agreement with the full conditions
# given in the SIESTA license, as signed by all legitimate users.
#
.SUFFIXES:
.SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90

SIESTA_ARCH=x86_64-unknown-linux-gnu--unknown

FPP=
FPP_OUTPUT=
FC=mpif90
RANLIB=ranlib

SYS=nag

SP_KIND=4
DP_KIND=8
KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND)

FFLAGS=-g -O2
FPPFLAGS=-DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT
LDFLAGS=

FFLAGS_DEBUG= -g -O2 # whatever options you might need,guohuazhong
DUMMY_FOX= --enable-dummy # whatever options you might need,guohuazhong

ARFLAGS_EXTRA=

FCFLAGS_fixed_f=
FCFLAGS_free_f90=
FPPFLAGS_fixed_F=
FPPFLAGS_free_F90=

#BLAS_LIBS=libblas.a
#LAPACK_LIBS=dc_lapack.a liblapack.a
#BLACS_LIBS=
#SCALAPACK_LIBS=

######BLAS_LIBS=-L/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/lib/em64t -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_lapack -lmkl_core -lguide -pthread
######LAPACK_LIBS=-L/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/lib/em64t -lmkl_sequential -lmkl_core -pthread
######BLACS_LIBS=-L/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/lib/em64t -lmkl_blacs_openmpi_lp64 -pthread
######SCALAPACK_LIBS=-L/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/lib/em64t -lmkl_scalapack_lp64 -pthread

#######################SCA=-L/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/lib/em64t -lmkl_blacs_intelmpi_lp64 -lmkl_scalapack_lp64
SCA=${MKLPATH}/libmkl_scalapack_lp64.a ${MKLPATH}/libmkl_solver_lp64_sequential.a -Wl,--start-group ${MKLPATH}/libmkl_intel_lp64.a ${MKLPATH}/libmkl_sequential.a ${MKLPATH}/libmkl_core.a ${MKLPATH}/libmkl_blacs_openmpi_lp64.a -Wl,--end-group -lpthread

#################BLAS=-L/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/lib/em64t -lmkl_intel_lp64 -lmkl_blas95_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_lapack95_lp64 -lmkl_core #-lguide -pthread
################LAPACK=-L/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/lib/em64t -lmkl_sequential -lmkl_lapack95_lp64 -lmkl_core #-pthread -lguide

MKLINCLUDE=/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/include
MKLPATH=/opt/intel/Compiler/11.1/059/mkl/lib/em64t
BLAS_LIBS=-L${MKLPATH} -I${MKLINCLUDE} -I${MKLINCLUDE}/em64t/lp64 -lmkl_blas95_lp64 -Wl,--start-group ${MKLPATH}/libmkl_intel_lp64.a ${MKLPATH}/libmkl_sequential.a ${MKLPATH}/libmkl_core.a -Wl,--end-group -lpthread
LAPACK_LIBS=-L${MKLPATH} -I${MKLINCLUDE} -I${MKLINCLUDE}/em64t/lp64 -lmkl_lapack95_lp64 -Wl,--start-group ${MKLPATH}/libmkl_intel_lp64.a ${MKLPATH}/libmkl_sequential.a ${MKLPATH}/libmkl_core.a -Wl,--end-group -lpthread

#COMP_LIBS=dc_lapack.a liblapack.a libblas.a

NETCDF_LIBS=
NETCDF_INTERFACE=

LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(NETCDF_LIBS) $(SCA)

#SIESTA needs an F90 interface to MPI
#This will give you SIESTA's own implementation
#If your compiler vendor offers an alternative, you may change
#to it here.
MPI_INTERFACE=libmpi_f90.a
MPI_INCLUDE=/opt/openmpi-1.6.3/include
#Dependency rules are created by autoconf according to whether
#discrete preprocessing is necessary or not.
.F.o:
$(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F)  $<
.F90.o:
$(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $<
.f.o:
$(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f)  $<
.f90.o:
$(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90)  $<

用上面给你arch.make,我想基本上可以编译通过了，只要你用的是intel的编译器，当然得修改相应的库，我用的是intel 11.1.059版本。

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ouyangyulou

2楼2013-04-02 21:49:52

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huangpu2009

铁虫 (小有名气)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by guohuazhong at 2013-04-02 21:49:52
#
# This file is part of the SIESTA package.
#
# Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid:
# E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal
# and J.M ...

谢谢，我是按着张老师的视频教程做的，就里面的一个-lmkl_solver没有，在lib文件夹下没找着这个文件，其他的好像都正常，我把这个去掉后，可以编译过去，但不知道最后生成的Siesta程序是不是完整。

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3楼2013-04-02 21:57:29

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love5264

木虫 (正式写手)

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★
感谢参与，应助指数 +1
huangpu2009: 金币+1, ★★★很有帮助, 非常感谢，明白了。 2013-04-03 12:41:41

这个不影响，现在新版MKL有变化。
#MKL
MKLPATH=/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/lib/intel64  #自己修改
SUGGESTED_LIBS=$(MKLPATH)/libmkl_scalapack_lp64.a \
            -Wl,--start-group \
               $(MKLPATH)/libmkl_intel_lp64.a \
               $(MKLPATH)/libmkl_sequential.a \
               $(MKLPATH)/libmkl_core.a \
               $(MKLPATH)/libmkl_blacs_openmpi_lp64.a \
            -Wl,--end-group \
            -lpthread -lm

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