应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 在gaussian计算中，先用小基组计算，在改成大基组计算出现的问题
243/3返回列表上一页123
查看: 2798  |  回复: 23
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

萱月琪琪

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
17楼: Originally posted by maynard at 2013-04-01 00:32:42
如果你需要在win下使用chk文件需要输入
formchk GDC4ofq4-1.chk &
得到fchk在win下使用，但这个显然没必要，你又不用看分子轨道啥的……

建议先提取小基组优化好的构型单独计算freq得到一个chk文件，如GDC ...

在linux下终端里面输入formchk GDC4ofq4-1.chk 可以得到.fchk文件了。在linux下可以打开.fchk看里面的信息，而.chk 是看不成。
<建议先提取小基组优化好的构型单独计算freq得到一个chk文件，如GDC4ofq4-1.chk 然后再用同一个构型（坐标最好不变的）>
①你的意思是我最好opt 与fre 分开计算？
如果opt fre一起计算的话，打开.fchk文件显示的是：
GDC4ofq4-1
Freq  b3lyp        6-311++g(d,p)
Numbei of atoms .........
②再用同一个构型指的是GDC4ofq4-1的最最初始的输入文件吗？还是怎么回事呀？
gjf里面输入：
%chk= GDC4ofq4-1.chk
%mem=600MW
%nproc=6
#p opt=rcfc freq b3lyp/6-311++g(d,p)

GDC4ofq4-1

1 1
C
C                  1              B1
.log显示Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
对于怎么在小基组的基础上再使用大的基组进行计算这个问题，我到现在还是没有解决。希望您在帮我解答下。
我是现在6-31的基础上做的计算，不过说是我用的基组小，叫改成6-311的。所以我想知道怎么操作的。因为要计算的文件比较多，单独算一个6-311基组下的用了8天还没结束，所以我想在已经算好的6-31基组上计算。不过一直出现问题。

③在linux里面操作：
输入%chk= GDC4ofq4-1.chk
%mem=600MW
%nproc=6
#p opt=rcfc freq b3lyp/6-311++g(d,p)

GDC4ofq4-1
（下面是从打开的fchk文件里面复制出来的）
Number of atoms                            I               31
Info1-9                                    I   N=           9
         160         160        1002           0           0         100
           6          18        -502
Charge                                     I         
。。。。。。。。
。log文件出错如下：
WANTED AN INTEGER AS INPUT.  FOUND A STRING AS INPUT.
Number of atoms                            I               31                  
   Error termination via Lnk1e in /home/gs/g09/l101.exe at Sat Apr 13 12:31:38 2013
赞一下 回复此楼
世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功
21楼2013-04-13 13:16:24
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maynard

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
21楼: Originally posted by 萱月琪琪 at 2013-04-13 13:16:24
在linux下终端里面输入formchk GDC4ofq4-1.chk 可以得到.fchk文件了。在linux下可以打开.fchk看里面的信息，而.chk 是看不成。
<建议先提取小基组优化好的构型单独计算freq得到一个chk文件，如GDC4ofq4-1.chk  ...

①你的意思是我最好opt 与fre 分开计算？
如果计算频率不花太多时间的话建议分开算，用小基组opt优化好的结构单独计算小基组freq
②再用同一个构型指的是GDC4ofq4-1的最最初始的输入文件吗？还是怎么回事呀？
不，是小基组opt优化好的结构。利用小基组freq的chk文件，rcfc关键词提取其中的力矩阵进行大基组的计算。就是要保证小基组freq和大基组opt用的结构是一样的。
③在linux里面操作出错。
WANTED AN INTEGER AS INPUT.  FOUND A STRING AS INPUT.
这是输入文件哪里格式写错了，是不是电荷或者自旋多重度那里写错了
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

萱月琪琪
22楼2013-04-14 00:14:14
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

萱月琪琪

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
22楼: Originally posted by maynard at 2013-04-14 00:14:14
①你的意思是我最好opt 与fre 分开计算？
如果计算频率不花太多时间的话建议分开算，用小基组opt优化好的结构单独计算小基组freq
②再用同一个构型指的是GDC4ofq4-1的最最初始的输入文件吗？还是怎么回事呀？
不 ...

我都已经把所有要计算的文件，都用6-31+（d，p）计算过opt+fre了，在重新在计算下，是不是会跟之前用的时间一样了呀！我最终要计算的是6-311++（d，p）的opt fre。我再次试试看哈！谢谢您的帮助了
赞一下 回复此楼
世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功
23楼2013-04-15 10:42:56
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
送红花一朵
本帖仅楼主可见
赞一下
24楼2015-11-23 17:45:09
 已阅   申请QC强帖   回复此楼   编辑   查看我的主页
相关版块跳转 我要订阅楼主 萱月琪琪 的主题更新
243/3返回列表上一页123
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭