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萱月琪琪

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
17楼: Originally posted by maynard at 2013-04-01 00:32:42
如果你需要在win下使用chk文件需要输入
formchk GDC4ofq4-1.chk &
得到fchk在win下使用,但这个显然没必要,你又不用看分子轨道啥的……

建议先提取小基组优化好的构型单独计算freq得到一个chk文件,如GDC ...

在linux下终端里面输入formchk GDC4ofq4-1.chk 可以得到.fchk文件了。在linux下可以打开.fchk看里面的信息,而.chk 是看不成。
<建议先提取小基组优化好的构型单独计算freq得到一个chk文件,如GDC4ofq4-1.chk 然后再用同一个构型(坐标最好不变的)>
①你的意思是我最好opt 与fre 分开计算?
如果opt fre一起计算的话,打开.fchk文件显示的是:
GDC4ofq4-1
Freq  b3lyp        6-311++g(d,p)
Numbei of atoms .........
②再用同一个构型指的是GDC4ofq4-1的最最初始的输入文件吗?还是怎么回事呀?
gjf里面输入:
%chk= GDC4ofq4-1.chk
%mem=600MW
%nproc=6
#p opt=rcfc freq b3lyp/6-311++g(d,p)

GDC4ofq4-1

1 1
C
C                  1              B1
.log显示Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
对于怎么在小基组的基础上再使用大的基组进行计算这个问题,我到现在还是没有解决。希望您在帮我解答下。
我是现在6-31的基础上做的计算,不过说是我用的基组小,叫改成6-311的。所以我想知道怎么操作的。因为要计算的文件比较多,单独算一个6-311基组下的用了8天还没结束,所以我想在已经算好的6-31基组上计算。不过一直出现问题。

③在linux里面操作:
输入%chk= GDC4ofq4-1.chk
%mem=600MW
%nproc=6
#p opt=rcfc freq b3lyp/6-311++g(d,p)

GDC4ofq4-1
(下面是从打开的fchk文件里面复制出来的)
Number of atoms                            I               31
Info1-9                                    I   N=           9
         160         160        1002           0           0         100
           6          18        -502
Charge                                     I         
。。。。。。。。
。log文件出错如下:
WANTED AN INTEGER AS INPUT.  FOUND A STRING AS INPUT.
Number of atoms                            I               31                  
   Error termination via Lnk1e in /home/gs/g09/l101.exe at Sat Apr 13 12:31:38 2013
世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功
21楼2013-04-13 13:16:24
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maynard

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
21楼: Originally posted by 萱月琪琪 at 2013-04-13 13:16:24
在linux下终端里面输入formchk GDC4ofq4-1.chk 可以得到.fchk文件了。在linux下可以打开.fchk看里面的信息,而.chk 是看不成。
<建议先提取小基组优化好的构型单独计算freq得到一个chk文件,如GDC4ofq4-1.chk  ...

①你的意思是我最好opt 与fre 分开计算?
如果计算频率不花太多时间的话建议分开算,用小基组opt优化好的结构单独计算小基组freq
②再用同一个构型指的是GDC4ofq4-1的最最初始的输入文件吗?还是怎么回事呀?
不,是小基组opt优化好的结构。利用小基组freq的chk文件,rcfc关键词提取其中的力矩阵进行大基组的计算。就是要保证小基组freq和大基组opt用的结构是一样的。
③在linux里面操作出错。
WANTED AN INTEGER AS INPUT.  FOUND A STRING AS INPUT.
这是输入文件哪里格式写错了,是不是电荷或者自旋多重度那里写错了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

22楼2013-04-14 00:14:14
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萱月琪琪

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
22楼: Originally posted by maynard at 2013-04-14 00:14:14
①你的意思是我最好opt 与fre 分开计算?
如果计算频率不花太多时间的话建议分开算,用小基组opt优化好的结构单独计算小基组freq
②再用同一个构型指的是GDC4ofq4-1的最最初始的输入文件吗?还是怎么回事呀?
不 ...

我都已经把所有要计算的文件,都用6-31+(d,p)计算过opt+fre了,在重新在计算下,是不是会跟之前用的时间一样了呀!我最终要计算的是6-311++(d,p)的opt fre。我再次试试看哈!谢谢您的帮助了
世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功
23楼2013-04-15 10:42:56
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匿名

用户注销 (小有名气)

送红花一朵
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24楼2015-11-23 17:45:09
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