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萱月琪琪

金虫 (正式写手)

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[求助] 在gaussian计算中，先用小基组计算，在改成大基组计算出现的问题

在gaussian计算中，先用小基组b3lyp/6-31+g(d,p)计算opt freq，选出最小稳定构型之后，再用b3lyp/6-311++g(d,p) 计算该构型下的opt freq，输入的命令如下，我怎么感觉我这是从头开始计算了呢。怎样输入命令是利用b3lyp/6-31+g(d,p)计算的结果进行的b3lyp/6-311++g(d,p) 呢？感谢您的帮助
（1）基组b3lyp/6-31+g(d,p)计算opt freq输入文件是：
%chk=GDC4ofq4-1.chk
%mem=600MW
%nproc=6
#p opt freq b3lyp/6-31+g(d,p) geom=connectivity

GDC4ofq4-1

1 1
C
C 1 B1

（2）基组b3lyp/6-311++g(d,p)计算opt freq输入文件是：
%chk= GDC4ofq4-1.chk
%mem=600MW
%nproc=6
#p opt freq b3lyp/6-311++g(d,p) geom=connectivity

GDC4ofq4-1

1 1
C
C 1 B1
怎样输入是在6-31基组的基础之上进行的计算呢，我这样输入是从新开始计算的，计算的时间特别久。输入文件我采用的是win下的gaussview软件，通过ssh上传到linux下计算的
先表示感谢了

[ Last edited by 萱月琪琪 on 2013-3-31 at 11:27 ]

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世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功

1楼2013-03-31 11:24:07

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萱月琪琪

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引用回帖:

17楼: Originally posted by maynard at 2013-04-01 00:32:42
如果你需要在win下使用chk文件需要输入
formchk GDC4ofq4-1.chk &
得到fchk在win下使用，但这个显然没必要，你又不用看分子轨道啥的……

建议先提取小基组优化好的构型单独计算freq得到一个chk文件，如GDC ...

在linux下终端里面输入formchk GDC4ofq4-1.chk 可以得到.fchk文件了。在linux下可以打开.fchk看里面的信息，而.chk 是看不成。
<建议先提取小基组优化好的构型单独计算freq得到一个chk文件，如GDC4ofq4-1.chk 然后再用同一个构型（坐标最好不变的）>
①你的意思是我最好opt 与fre 分开计算？
如果opt fre一起计算的话，打开.fchk文件显示的是：
GDC4ofq4-1
Freq  b3lyp       6-311++g(d,p)
Numbei of atoms .........
②再用同一个构型指的是GDC4ofq4-1的最最初始的输入文件吗？还是怎么回事呀？
gjf里面输入：
%chk= GDC4ofq4-1.chk
%mem=600MW
%nproc=6
#p opt=rcfc freq b3lyp/6-311++g(d,p)

GDC4ofq4-1

1 1
C
C                1             B1
.log显示Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
对于怎么在小基组的基础上再使用大的基组进行计算这个问题，我到现在还是没有解决。希望您在帮我解答下。
我是现在6-31的基础上做的计算，不过说是我用的基组小，叫改成6-311的。所以我想知道怎么操作的。因为要计算的文件比较多，单独算一个6-311基组下的用了8天还没结束，所以我想在已经算好的6-31基组上计算。不过一直出现问题。

③在linux里面操作：
输入%chk= GDC4ofq4-1.chk
%mem=600MW
%nproc=6
#p opt=rcfc freq b3lyp/6-311++g(d,p)

GDC4ofq4-1
（下面是从打开的fchk文件里面复制出来的）
Number of atoms                         I             31
Info1-9                                  I N=          9
      160       160       1002          0          0       100
         6       18       -502
Charge                                  I
。。。。。。。。
。log文件出错如下：
WANTED AN INTEGER AS INPUT.  FOUND A STRING AS INPUT.
Number of atoms                         I             31
Error termination via Lnk1e in /home/gs/g09/l101.exe at Sat Apr 13 12:31:38 2013