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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 求助cif检查的错误
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jwj0815

金虫 (小有名气)

[交流] 求助cif检查的错误

PLAT031_ALERT_4_A Refined Extinction Parameter within Range ......       0.17 Sigma
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       6.37 Ratio
PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         O8     
PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C23     
PLAT355_ALERT_3_A Long    O-H Bond (0.82A)   O9     -   H9B    ...       1.22 Ang.
PLAT414_ALERT_2_A Short Intra D-H..H-X       H1B    ..  H9B     ..       1.74 Ang.
--------------------------------------------------------------------------------Alert level B
PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent    N     Ueq(max)/Ueq(min) ...       4.07 Ratio
PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent    O     Ueq(max)/Ueq(min) ...       4.32 Ratio
PLAT222_ALERT_3_B Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       4.64 Ratio
PLAT242_ALERT_2_B Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for        Cu2     
PLAT242_ALERT_2_B Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for        C19     
PLAT333_ALERT_2_B Large Average Benzene C-C Dist.  C4     -C12           1.46 Ang.
PLAT355_ALERT_3_B Long    O-H Bond (0.82A)   O1     -   H1D    ...       1.11 Ang.
PLAT369_ALERT_2_B Long   C(sp2)-C(sp2) Bond  C19    -   C19_e  ...       1.58 Ang.
PLAT369_ALERT_2_B Long   C(sp2)-C(sp2) Bond  C20    -   C24    ...       1.64 Ang.
PLAT432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O11    ..  C6      ..       2.81 Ang.
PLAT432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O11    ..  C5      ..       2.84 Ang.
PLAT432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O13    ..  C6      ..       2.87 Ang.
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1楼 2007-09-08 15:32:54
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douvei

金虫 (正式写手)
PLAT333_ALERT_2_B Large Average Benzene C-C Dist.  C4     -C12           1.46 Ang.
PLAT355_ALERT_3_B Long    O-H Bond (0.82A)   O1     -   H1D    ...       1.11 Ang.
PLAT369_ALERT_2_B Long   C(sp2)-C(sp2) Bond  C19    -   C19_e  ...       1.58 Ang.
PLAT369_ALERT_2_B Long   C(sp2)-C(sp2) Bond  C20    -   C24    ...       1.64 Ang.
可能需要您对这些键长进行一定的限制（用dfix指令等），这都是小问题
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4楼2007-09-09 02:24:00
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douvei

金虫 (正式写手)
PLAT355_ALERT_3_A Long    O-H Bond (0.82A)   O9     -   H9B    ...       1.22 Ang.
PLAT414_ALERT_2_A Short Intra D-H..H-X       H1B    ..  H9B     ..       1.74 Ang.
这两个错误好像是加氢的位置不合适，或被加氢的原子定错造成的，请检查
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2楼2007-09-09 02:18:43
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douvei

金虫 (正式写手)
PLAT031_ALERT_4_A Refined Extinction Parameter within Range ......       0.17 Sigma
可能是两种原因：
（1）精修的次数不够，可以多修几轮
（2）如果还不行，可能是没有必要对消光参数进行精修，可以删除该指令
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3楼2007-09-09 02:21:56
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douvei

金虫 (正式写手)
PLAT432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O11    ..  C6      ..       2.81 Ang.
PLAT432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O11    ..  C5      ..       2.84 Ang.
PLAT432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O13    ..  C6      ..       2.87 Ang.
个人意见：可以不理会
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5楼2007-09-09 02:24:52
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