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spirte雷

木虫 (小有名气)

[求助] 断二硫键

怎么断两个单体之间的二硫键?
现在要模拟的是两个相互作用的蛋白,但是结晶结构中是将两个蛋白之间形成了二硫键来得到的,一开始打算把形成二硫键的两个半胱氨酸突变回野生型,但是跑的时候出现段错误,无法解决。所以打算把两个蛋白之间的这个二硫键断开,但不知道怎么断?求助虫友们...
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yyuan8658

金虫 (正式写手)

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-02 08:33:11
不突变回CYS,还是用CYX,但是不用bond命令把两个CYX连在一起
不知道这种方式是否可行
2楼2013-04-01 15:18:06
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spirte雷

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yyuan8658 at 2013-04-01 15:18:06
不突变回CYS,还是用CYX,但是不用bond命令把两个CYX连在一起
不知道这种方式是否可行

我用的是gromacs,不知道怎么去用bond命令,能帮忙再讲解一下吗?
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3楼2013-04-01 17:24:37
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