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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 请问各位高手NAMD最小化后得到的最后一帧怎么保存为pdb格式啊
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qxluan88

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-03-28 17:52:43
多看看手册，
你先应该弄明白，你能量最小化输出了哪些东西？
输出的那些文件，每个文件是什么意思？
这些手册上都讲解的很清楚

PS,为什么一定要PDB文件呢？
一般模拟，能量最小化之后该进行别的模拟了啊， ...

你好，我想请教一个问题，就是我在用AutoDock做对接时，run docking的时候运行过程中是能够看到dlg文件的数据输出，包括做到第几个对接的，但是运行结束后，显示successful，dlg文件却突然变成空的了，这是什么原因呢
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11楼2013-08-22 17:54:15
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
11楼: Originally posted by qxluan88 at 2013-08-22 17:54:15
你好，我想请教一个问题，就是我在用AutoDock做对接时，run docking的时候运行过程中是能够看到dlg文件的数据输出，包括做到第几个对接的，但是运行结束后，显示successful，dlg文件却突然变成空的了，这是什么原因 ...

抱歉，我没有用过AutoDock ，对此软件一无所知
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12楼2013-08-22 19:18:42
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