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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS 里面的所有模块都是基于第一性原理来编写的么？ GULP模块是不是？
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anlen0615

银虫 (小有名气)

[求助] MS 里面的所有模块都是基于第一性原理来编写的么？ GULP模块是不是？

如题！   大神们   给点建议哈！
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厚积而薄发！
1楼 2013-03-27 15:02:34
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

倔强的坚果墙

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-04-01 21:44:41
引用回帖:
3楼: Originally posted by anlen0615 at 2013-03-27 17:14:59
Why？

粗略的应用gulp拟合过势参数，当时的思路就是运用第一性原理计算的能量和gulp经典的势参数计算的能量比较
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anlen0615
像小强一样活着
4楼2013-03-27 20:38:07
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-04-01 21:45:02
引用回帖:
5楼: Originally posted by anlen0615 at 2013-03-28 17:38:01
红花送上！  大神！   如果我用GULP模块来模拟离子在晶体中的扩散作用，可行么？  望赐教！...

你这离子扩散属于MD的范畴吧  dl_poly，lammps可能比gulp更合适点
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anlen0615
6楼2013-03-28 19:49:57
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普通回帖

倔强的坚果墙

铁杆木虫 (正式写手)
gulp不是吧
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像小强一样活着
2楼2013-03-27 16:10:22
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anlen0615

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 倔强的坚果墙 at 2013-03-27 16:10:22
gulp不是吧

Why？
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厚积而薄发！
3楼2013-03-27 17:14:59
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anlen0615

银虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 倔强的坚果墙 at 2013-03-27 20:38:07
粗略的应用gulp拟合过势参数，当时的思路就是运用第一性原理计算的能量和gulp经典的势参数计算的能量比较...

红花送上！  大神！   如果我用GULP模块来模拟离子在晶体中的扩散作用，可行么？  望赐教！
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厚积而薄发！
5楼2013-03-28 17:38:01
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anlen0615

银虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by emilyoyang at 2013-03-28 19:49:57
你这离子扩散属于MD的范畴吧  dl_poly，lammps可能比gulp更合适点...

鲜花送上！  大神！  我想要得到离子在晶体中的扩散轨迹，  用MS的那个模块计算出来的数据  社会认可度高点哈！    望赐教！  感谢先！
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厚积而薄发！
7楼2013-03-29 21:34:43
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
anlen0615: 金币+1 2013-03-31 14:27:35
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-04-01 21:45:21
引用回帖:
7楼: Originally posted by anlen0615 at 2013-03-29 21:34:43
鲜花送上！  大神！  我想要得到离子在晶体中的扩散轨迹，  用MS的那个模块计算出来的数据  社会认可度高点哈！    望赐教！  感谢先！...

MS里面好像没有适合离子晶体扩散计算的模块，Gulp也可以，但好像J.D. Gale不太建议GULP来做MD计算，我的建议还会你用dl_poly来做离子晶体相关扩散的研究，用这款软件包来做的话，大家都是认可的。dl_poly也很好学
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8楼2013-03-30 12:46:09
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anlen0615

银虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by emilyoyang at 2013-03-30 12:46:09
MS里面好像没有适合离子晶体扩散计算的模块，Gulp也可以，但好像J.D. Gale不太建议GULP来做MD计算，我的建议还会你用dl_poly来做离子晶体相关扩散的研究，用这款软件包来做的话，大家都是认可的。dl_poly也很好学...

还有个问题  希望大神赐教：
我在MS中用一个模块去论述一个问题   再用另外一个模块去辅助证明一下这个问题
  比如   用CASTEP去算一下迁移势垒  得到一个最佳路径  再用Dmol3 去算一下MD证明最佳迁移路径      这样用两个模块在论文中可能使用？  求大神指点+++
    鄙人金币虽少   但必不吝啬！
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厚积而薄发！
9楼2013-03-30 14:18:30
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
anlen0615: 金币+2 2013-03-31 14:27:24
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-04-01 21:47:18
引用回帖:
9楼: Originally posted by anlen0615 at 2013-03-30 14:18:30
还有个问题  希望大神赐教：
我在MS中用一个模块去论述一个问题   再用另外一个模块去辅助证明一下这个问题
  比如   用CASTEP去算一下迁移势垒  得到一个最佳路径  再用Dmol3 去算一下MD证明最佳迁移路径       ...

如果算离子晶体中的迁移能垒的话，CASTEP算的不准确，文献中常见的CASTEP做过渡态一般都采用constrained minimization approach（很多文献你可以自己搜一下）。Dmol做MD可以，
你的想法不错，我目前没见过有你这样想法的论文。
看到过用VASP 计算能垒和AIMD来证明的文章，可能有异曲同工之妙。
但也可能会存在问题一定的问题，另外，不知道你为什么对MS这么情有独钟。
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anlen0615
10楼2013-03-30 21:57:43
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