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tlq615木虫 (小有名气)
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EST序列拼接是否需要选择 Repeat Masking
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我在使用EGassembler拼接大约20万条EST序列,发现如果不选择Repeat Masking 这一步,在拼接结果中搜索到的SSR数量远高于进行了Repeat Masking这一步(大约是2-3倍的差异)。 想请问一下各位生物信息学高手,如果我是为了统计拼接序列中的SSR数量,该不该选择Repeat Masking这一步?并希望能尽可能详细地解释一下原因,谢谢! |
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