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tlq615

木虫 (小有名气)

[求助] EST序列拼接是否需要选择 Repeat Masking

我在使用EGassembler拼接大约20万条EST序列,发现如果不选择Repeat Masking 这一步,在拼接结果中搜索到的SSR数量远高于进行了Repeat Masking这一步(大约是2-3倍的差异)。
想请问一下各位生物信息学高手,如果我是为了统计拼接序列中的SSR数量,该不该选择Repeat Masking这一步?并希望能尽可能详细地解释一下原因,谢谢!
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tlq615

木虫 (小有名气)

顶一顶,急等解答啊!
2楼2013-03-28 16:48:35
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zhangyanfangyes

铜虫 (小有名气)

这个你怎么拼接的,正在学习EST序列拼接,用得到的unigene。
http://egassembler.hgc.jp/是这个地址吗
3楼2014-04-28 17:22:02
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莲影青漫

新虫 (初入文坛)

初学,先看看
4楼2015-11-05 01:41:15
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