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nnipp

金虫 (小有名气)

[求助] 从cube文件画静电势图

在服务器上生成cube文件后在GV中打开生成表面的时候发现New Mapped Surface选项不能选，只能生成电荷密度图如何生成静电势图。是什么原因呢？

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功不唐捐
1楼 2013-03-22 14:00:25
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
从wfn文件、或者GS可以计算出各种cube文件，但生成的density的cube文件只能得到density图。要生成静电势的cube文件才能生成静电势图。
但如果在GV中输入fch文件，也可据density数据计算出静电势图。
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2楼2013-03-22 14:26:17
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nnipp

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2013-03-22 14:26:17
从wfn文件、或者GS可以计算出各种cube文件，但生成的density的cube文件只能得到density图。要生成静电势的cube文件才能生成静电势图。
但如果在GV中输入fch文件，也可据density数据计算出静电势图。

谢谢您。对于小分子我通过gv的cube actions==》new cube生成cube以后surface actions==》New Mapped Surface中ESP是可选的。但是对于大体系本机算不懂，因此通过服务器生成density的cube文件。但是打开以后New Mapped Surface选项不能选，是什么原因呢？
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功不唐捐
3楼2013-03-22 14:33:52
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

对于大体系本机算不动，但不能生成density的cube文件去画静电势图。可以在计算时得一个wfn文件，然后在multiwfn中生成一个静电势的cube文件才能生成静电势图。
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nnipp
4楼2013-03-22 14:43:31
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nnipp

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhou2009 at 2013-03-22 14:43:31
对于大体系本机算不动，但不能生成density的cube文件去画静电势图。可以在计算时得一个wfn文件，然后在multiwfn中生成一个静电势的cube文件才能生成静电势图。

非常感谢版主。再问一下，已经算好的结果有log,chk,fchk,cube如何得到wfn文件呢？具体的操作步骤应该怎样呢？
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功不唐捐
5楼2013-03-22 15:57:17
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nnipp: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-03-22 16:39:02
ben_ladeng: 金币+2, 谢谢解答 2013-03-22 16:47:05
将fchk读入multiwfn中，可以直接得到静电势的cube。
fchk也可以在multiwfn中先改写成wfn文件。

[ Last edited by zhou2009 on 2013-3-22 at 16:10 ]
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6楼2013-03-22 16:09:48
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