24小时热门版块排行榜    

查看: 725  |  回复: 4

lyfxie8607

木虫 (著名写手)

[求助] amber计算受体配体Decomposition怎么做出这样的图?

想用amber计算受体-配体相互作用的模拟,
看了几篇文献,可以算出各个氨基酸残基和配体的作用能量,似乎是amber中的Decomposition。请问这样的图怎么做出来呀?

还有看amber的教程好像说只有amber11能计算Decomposition,但文献中用amber8或10也做了Decomposition这样的计算,求解释。

1.jpg



2.jpg



3.jpg
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

amber

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyfxie8607

木虫 (著名写手)

自己想明白了,用exl应该可以做的。
2楼2013-03-19 11:05:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jamesxue

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
lyfxie8607前辈:
     前辈好!我在坛子里提了个问题,也是关于mmpbsa的~~~~前辈能抽空指导一二吗?辛苦前辈了!!!以下为帖子链接:http://www.bioms.org/thread-538-1-1.html
     另,我在短消息也把情况和前辈说了~~~谢过前辈先了!!!
                                                                                        james小弟
3楼2013-04-20 00:22:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyfxie8607

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jamesxue at 2013-04-20 00:22:56
lyfxie8607前辈:
     前辈好!我在坛子里提了个问题,也是关于mmpbsa的~~~~前辈能抽空指导一二吗?辛苦前辈了!!!以下为帖子链接:http://www.bioms.org/thread-538-1-1.html
     另,我在短消息也把情况和前 ...

本人并非高手,如有疑问请将问题发在本论坛进行探讨,以免有为其他论坛做广告嫌疑。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-04-20 13:28:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jamesxue

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by lyfxie8607 at 2013-04-20 13:28:48
本人并非高手,如有疑问请将问题发在本论坛进行探讨,以免有为其他论坛做广告嫌疑。...

好的,前辈!!抱歉由于自己疏忽,可能让大伙误解了,以下为虫虫链接~ http://muchong.com/bbs/viewthread.php?emobile=1&tid=5785042,辛苦前辈了!!

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2013-04-20 17:20:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lyfxie8607 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿河北工业大学0817化工278分求调剂 +7 jhybd 2026-03-23 12/600 2026-03-24 09:03 by jhybd
[考研] 化学308分求调剂 +3 你好明天你好 2026-03-23 3/150 2026-03-23 20:11 by macy2011
[考研] 工科0856求调剂 +5 沐析汀汀 2026-03-21 5/250 2026-03-23 17:56 by 海瑟薇-
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +5 葵梓卫队 2026-03-18 7/350 2026-03-23 16:26 by lingjue
[考研] 材料与化工085600,总分304,本科有两篇sci参与,求调剂 +4 幸运的酱酱 2026-03-22 5/250 2026-03-22 20:15 by edmund7
[考研] 315分,诚求调剂,材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 265求调剂 +3 Jack?k?y 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:17 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:32 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
信息提示
请填处理意见