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peng5053银虫 (正式写手)
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蛋白质组学 bruker 公司的定量软件proteinscapeCV值
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站内的各位高人朋友们,不知道谁用过bruker 公司的定量软件proteinscape?我在分析蛋白质组学的定量数据时,一直都遇到一个很头疼的问题:CV值比较高。不知道各位前辈有没有好的建议和经验。 [ Last edited by wizardfan on 2013-3-17 at 17:53 ] |
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wizardfan
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2楼2013-03-17 17:55:32
peng5053
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3楼2013-03-18 08:53:09
wizardfan
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【答案】应助回帖
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silicare: 金币+5, BioEPI+1, 应助指数+1, 2013-03-18 12:16:07
silicare: 金币+5, BioEPI+1, 应助指数+1, 2013-03-18 12:16:07
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SILAC是MS1 labelled了,好像maxquant是用的比较多的一个软件。 关于格式转换,PSI推出了很多标准格式,比如spectral的是mzML。bruker软件CompassXport(http://www.ionsource.com/functio ... rt/CompassXport.htm)可以生成mzXML,这个格式应该也有很多软件支持。 proteowizard是用的最多的格式转换软件,支持的格式有http://proteowizard.sourceforge.net/formats.shtml。 |
4楼2013-03-18 09:07:19
peng5053
银虫 (正式写手)
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5楼2013-03-20 23:00:19
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