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shiliyusly新虫 (小有名气)
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简并引物
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大家好，我现在在设计杨梅里己糖激酶的简并引物，想做这个基因的QPCR,主要目的是看这个酶的基因在不同品种杨梅表达的差异。 在ncbi搜索蛋白质序列的时候出现不同种酶（如下图），那这几种是同工酶还是基因家族啊？ 我有必要把这所有种的都测序出来吗？最好是能做全吧，那我这简并引物该怎么设计呢？ 我现在只设计了一对，在测序中。。。 请高手指教下啊，非常感谢！！！  N}KP5@EH$`W[BLDLDG2Q2QU.jpg |
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shiliyusly
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6楼2013-03-20 09:10:17
cicelyzh
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【答案】应助回帖
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shiliyusly: 金币+3 2013-03-13 13:27:07
感谢参与，应助指数 +1
shiliyusly: 金币+3 2013-03-13 13:27:07
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从预测的功能来看，至少它们有可能是催化同一反应的，也就是所谓的同工酶。蛋白序列长度差不多，很可能是基因家族。你可以把这几个蛋白序列做一下alignment，看看同源性如何。 简并引物的设计参考 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3011161 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1841791 |
2楼2013-03-12 23:41:13
shiliyusly
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3楼2013-03-13 15:08:52
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4楼2013-03-19 21:43:37
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