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jlsdyac

木虫 (正式写手)

[交流] 请教相互作用能的问题 已有2人参与

最近优化一离子化合物与丙酮的最稳定结构,用了两种方法:
1、先得到离子化合物的优化构型,在这个基础上,摆放丙酮分子,得到一能量较低的“构型1”;
2、将1中优化好的离子化合物优化构型的阴阳离子相对位置移动了,然后再摆放丙酮分子,得到另一“构型2";
然后对"构型1"和"构型2”做bsse校正,比较相互作用能。

可听人说这样比较是不对的,因为2中我移动了纯离子化合物阴阳离子的位置,那么“离子化合物-丙酮”的优化构型就是从不同的“纯离子化合物优化构型”出发的。

我初学高斯,对这个不懂,请各位帮忙解释一下,上述方法为啥不能比较?应该如何比较相互作用能大小?谢谢
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zhou2009

版主 (著名写手)

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gmy1990: 金币+3 2013-03-12 19:44:26
先得到离子化合物的优化构型,在这个基础上,摆放丙酮分子。
问题是摆放丙酮分子之后你对整个体系进行了优化吗?这时离子化合物在加了丙酮分子之后还是要变化的。
还是只优化丙酮分子?还是完全不优化?

阴阳离子相对位置移动之后,再摆放丙酮分子,你全优化了吗?......

如果没有作全优化,它的误差远大于bsse校正,这时bsse校正是没有意义的。
2楼2013-03-10 16:15:38
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jlsdyac

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2013-03-10 16:15:38
先得到离子化合物的优化构型,在这个基础上,摆放丙酮分子。
问题是摆放丙酮分子之后你对整个体系进行了优化吗?这时离子化合物在加了丙酮分子之后还是要变化的。
还是只优化丙酮分子?还是完全不优化?

阴阳离 ...

谢谢您的回复。摆放丙酮分子之后 全部优化了
3楼2013-03-10 16:59:07
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夏天的娃

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
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gmy1990: 金币+2 2013-03-12 19:44:36
LZ难道是做ILs与丙酮么?
在第一种里面,如果先分别优化了离子对,丙酮,以及离子对+丙酮,然后做BSSE的话是针对离子对与丙酮的相互作用能。
第二种,“将1中优化好的离子化合物优化构型的阴阳离子相对位置移动了,然后再摆放丙酮分子”.这个有问题呀。除非你再对离子对的空间摆放调整并且优化后,再加入优化好的丙酮,再得到新的离子对-丙酮,做BSSE。这样的得到的相互作用能就是新构型下的离子对-丙酮的作用能。

这样第一种和第二种才可以比较。。。。。。。

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4楼2013-03-12 17:47:47
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jlsdyac

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 夏天的娃 at 2013-03-12 17:47:47
LZ难道是做ILs与丙酮么?
在第一种里面,如果先分别优化了离子对,丙酮,以及离子对+丙酮,然后做BSSE的话是针对离子对与丙酮的相互作用能。
第二种,“将1中优化好的离子化合物优化构型的阴阳离子相对位置移动了 ...

感谢您的回复!我是做ILs与丙酮的。还想再请教一个问题:
如果
1、我先优化离子对,再加丙酮,得到最稳定"构型1";
2、阴离子、阳离子、丙酮随便放得到最稳定“构型2”。

从gview的summary里面比较,“构型1”比“构型2”能量高,但我试了好久,用第一种方法得不到“构型2”。

我想问下我这种比较方式对不对?构型2是否被认为是最稳定构型? 谢谢
5楼2013-03-13 10:10:24
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夏天的娃

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by jlsdyac at 2013-03-13 10:10:24
感谢您的回复!我是做ILs与丙酮的。还想再请教一个问题:
如果
1、我先优化离子对,再加丙酮,得到最稳定"构型1";
2、阴离子、阳离子、丙酮随便放得到最稳定“构型2”。

从gview的summary里面比较 ...

阴离子、阳离子、丙酮随便放得到最稳定“构型2”。
你这样做的话也可以做BSSE,但是是counterpoise=3,得到的是3个分子片段的相互作用能,而不是稳定的某一种离子对与丙酮的作用能。。
你需要看的是你要算3个片段的还离子对与丙酮的作用能?
如果要算离子对与丙酮的作用能,那么久不能使用方法2
6楼2013-03-13 14:29:38
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jlsdyac

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 夏天的娃 at 2013-03-13 14:29:38
阴离子、阳离子、丙酮随便放得到最稳定“构型2”。
你这样做的话也可以做BSSE,但是是counterpoise=3,得到的是3个分子片段的相互作用能,而不是稳定的某一种离子对与丙酮的作用能。。
你需要看的是你要算3个片段 ...

感谢夏天的娃,您果然是大神,我的纠结正在于此,您的回复让我茅塞顿开,再次感谢!!
7楼2013-03-13 18:47:04
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夏天的娃

金虫 (小有名气)


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引用回帖:
7楼: Originally posted by jlsdyac at 2013-03-13 18:47:04
感谢夏天的娃,您果然是大神,我的纠结正在于此,您的回复让我茅塞顿开,再次感谢!!...


没有没有。。。只是自己也弄过这个。。共勉哈
8楼2013-03-13 19:37:18
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