应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » CCDC索取的MOF的cif文件导入到MS中后显示的结构与文献中的不一致
232/3返回列表上一页123下一页
查看: 2811  |  回复: 22
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by zyj8119 at 2013-03-16 20:43:20
我导入ZIF-8的时候也出现了同样的问题，强制make p1仍然不行。。...

我这边发帖问了，也没有得到解决，不知道是不是发的版块不对
赞一下 回复此楼
11楼2013-03-16 23:45:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Voland

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
shiyiwenren: 金币+3, ★有帮助, 在晶体里改键和杂化方式会出现在改其中某一个键的时候，会出现晶胞里很多键同时发生改变 2013-10-28 17:55:28
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-11-28 08:36:33
那个……既然你能从散点得到结果，我想可以直接在MS上修改键和杂化方式的类型吧？至少ZIF-8我是那么做的……
赞一下 回复此楼
Yağma！Yağma！Yağma！
12楼2013-10-28 17:17:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangqing2002108

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-11-28 08:36:49
shiyiwenren: 金币+3, ★有帮助 2013-11-28 15:38:09
从CCDC上面下载的CIF文件最好不要用MS打开，用Diamond3.0可以打开的很好，也可以用CCDC网站提供的Mecury1.3软件打开
赞一下 回复此楼
祝愿小木虫论坛永远红火！
13楼2013-11-28 08:01:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by wangqing2002108 at 2013-11-28 08:01:03
从CCDC上面下载的CIF文件最好不要用MS打开，用Diamond3.0可以打开的很好，也可以用CCDC网站提供的Mecury1.3软件打开

那用Diamond3.0或者Mecury1.3打开之后能保存成MS读入后显示正常的文件吗，因为之后还要用MS对这个结构进行优化等模拟的。
赞一下 回复此楼
14楼2013-11-28 15:37:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangqing2002108

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
shiyiwenren: 金币+3, ★有帮助 2013-11-28 23:46:17
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-11-29 08:52:22
我没有用过MS，所以我不知道MS需要什么样格式的文件，我只是知道用Diamond3.2可以顺利打开cif文件，具体它能否把文件转换为其他楼主需要的格式，你可看看下图：
赞一下 回复此楼
祝愿小木虫论坛永远红火！
15楼2013-11-28 17:36:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangqing2002108

铁杆木虫 (职业作家)
看看这个图片中，另存为的文件格式中有没有你用着的
CCDC索取的MOF的cif文件导入到MS中后显示的结构与文献中的不一致
Diamond 3.2另存图片.png
赞一下 回复此楼
祝愿小木虫论坛永远红火！
16楼2013-11-28 17:39:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shiyiwenren: 金币+2, ★有帮助 2013-11-28 23:51:21
引用回帖:
11楼: Originally posted by shiyiwenren at 2013-03-16 23:45:22
我这边发帖问了，也没有得到解决，不知道是不是发的版块不对...

师弟，你这个问题已经解决了，IRMOF系列的氢出现重合的原子，就是先make p1,再加氢就可以了。。。
赞一下 回复此楼
好好学习，天天向上。
17楼2013-11-28 22:09:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by wangqing2002108 at 2013-11-28 17:36:24
我没有用过MS，所以我不知道MS需要什么样格式的文件，我只是知道用Diamond3.2可以顺利打开cif文件，具体它能否把文件转换为其他楼主需要的格式，你可看看下图：

MS是可以打开cif文件的，我就是不知道Diamond3.2这个软件另存为的cif文件是否与之前从CCDC里下载的cif相比是否有过改进。
赞一下 回复此楼
18楼2013-11-28 23:46:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by zyj8119 at 2013-11-28 22:09:48
师弟，你这个问题已经解决了，IRMOF系列的氢出现重合的原子，就是先make p1,再加氢就可以了。。。...

确定是这样弄的吗，你测试过没有？我先试试看。
赞一下 回复此楼
19楼2013-11-28 23:47:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by zyj8119 at 2013-11-28 22:09:48
师弟，你这个问题已经解决了，IRMOF系列的氢出现重合的原子，就是先make p1,再加氢就可以了。。。...

我试了一下，还是不行，是把我上传的zif-7的结构下载试试看。
赞一下 回复此楼
20楼2013-11-28 23:51:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shiyiwenren 的主题更新
232/3返回列表上一页123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭