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Tracyxi

铜虫 (小有名气)

[求助] guassian中过渡态的做法

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我是菜鸟，想问一下，Gaussian计算过渡态的具体做法，网各位能给指点一下，不胜感激！！OST2QST3应该怎么才能用，为什么我的这两个算法是灰色的呢？求指导
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1楼 2013-03-08 08:41:54
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ssy_4222

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zxy964777869 at 2013-03-09 12:34:32
gaussian怎么说也只是一个软件，你如果用它算东西，需要按照一定的规则指定输入文件，比如qst2，你需要先将反应物和产物的结构分别优化，随后对原子进行配对，就可以进行初步的过渡态搜索了，以后还要进行过渡态频率 ...

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上善若水
8楼2013-03-13 19:51:13
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zxy964777869

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2013-03-09 14:36:15
gaussian怎么说也只是一个软件，你如果用它算东西，需要按照一定的规则指定输入文件，比如qst2，你需要先将反应物和产物的结构分别优化，随后对原子进行配对，就可以进行初步的过渡态搜索了，以后还要进行过渡态频率验证以及反应路径扫描等后续问题。具体的gaussian说明书上以及一些教程中说的很明白。
你的选项是灰色的估计是你只提供了反应物吗，qst2要求有两个输入构型同时存在。qst3则要求反应物，产物，推测的过渡态结构三者同时提供才可以用来提交计算。
建议，先把gaussian说明书过渡态计算以及exploring chemistry with electronic structure（第二版）看完，在进行计算。
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Tracyxi
2楼2013-03-09 12:34:32
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hellogagaga

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我也是刚刚接触Gaussian，感觉楼上说的很有道理。前段时间看的帖子感觉挺有帮助，建议你看一下。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3270751
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3楼2013-03-09 20:33:07
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Tracyxi

铜虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zxy964777869 at 2013-03-09 12:34:32
gaussian怎么说也只是一个软件，你如果用它算东西，需要按照一定的规则指定输入文件，比如qst2，你需要先将反应物和产物的结构分别优化，随后对原子进行配对，就可以进行初步的过渡态搜索了，以后还要进行过渡态频率 ...

再请问一下，反应物和生成物怎么同时输入呢。。。高手赐教，我刚接触这个非常菜
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4楼2013-03-11 13:18:49
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