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Tracyxi

铜虫 (小有名气)

[求助] guassian中过渡态的做法

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我是菜鸟,想问一下,Gaussian计算过渡态的具体做法,网各位能给指点一下,不胜感激!!OST2QST3应该怎么才能用,为什么我的这两个算法是灰色的呢?求指导
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zxy964777869

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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gmy1990: 金币+3 2013-03-09 14:36:15
gaussian怎么说也只是一个软件,你如果用它算东西,需要按照一定的规则指定输入文件,比如qst2,你需要先将反应物和产物的结构分别优化,随后对原子进行配对,就可以进行初步的过渡态搜索了,以后还要进行过渡态频率验证以及反应路径扫描等后续问题。具体的gaussian说明书上以及一些教程中说的很明白。
你的选项是灰色的估计是你只提供了反应物吗,qst2要求有两个输入构型同时存在。qst3则要求反应物,产物,推测的过渡态结构三者同时提供才可以用来提交计算。
建议,先把gaussian说明书过渡态计算以及exploring chemistry with electronic structure(第二版)看完,在进行计算。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-03-09 12:34:32
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hellogagaga

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也是刚刚接触Gaussian,感觉楼上说的很有道理。前段时间看的帖子感觉挺有帮助,建议你看一下。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3270751
3楼2013-03-09 20:33:07
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Tracyxi

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zxy964777869 at 2013-03-09 12:34:32
gaussian怎么说也只是一个软件,你如果用它算东西,需要按照一定的规则指定输入文件,比如qst2,你需要先将反应物和产物的结构分别优化,随后对原子进行配对,就可以进行初步的过渡态搜索了,以后还要进行过渡态频率 ...

再请问一下,反应物和生成物怎么同时输入呢。。。高手赐教,我刚接触这个非常菜
4楼2013-03-11 13:18:49
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Tracyxi

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hellogagaga at 2013-03-09 20:33:07
我也是刚刚接触Gaussian,感觉楼上说的很有道理。前段时间看的帖子感觉挺有帮助,建议你看一下。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3270751

谢谢分享哦!!!
5楼2013-03-11 13:19:39
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zxy964777869

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by Tracyxi at 2013-03-11 13:18:49
再请问一下,反应物和生成物怎么同时输入呢。。。高手赐教,我刚接触这个非常菜...

如图:
注:改图只做输入示范,无实际意义。

输入.jpg

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2013-03-11 14:31:37
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Tracyxi

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by zxy964777869 at 2013-03-11 14:31:37
如图:
注:改图只做输入示范,无实际意义。

输入.jpg
...

万分感激,谢谢高手不吝赐教
7楼2013-03-12 09:46:25
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ssy_4222

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zxy964777869 at 2013-03-09 12:34:32
gaussian怎么说也只是一个软件,你如果用它算东西,需要按照一定的规则指定输入文件,比如qst2,你需要先将反应物和产物的结构分别优化,随后对原子进行配对,就可以进行初步的过渡态搜索了,以后还要进行过渡态频率 ...

很中肯的回答,赞一个
上善若水
8楼2013-03-13 19:51:13
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