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jinqimaggie

铁虫 (小有名气)

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[求助] 求助，如何验证我设计的primer是否可以做出帖子中的目标miRNA?谢谢！！！！！

我有两个primer, 目标miRNA序列在最下边，我想知道怎么样能查出我的primer设计得对不对，是否能做出我的目标miRNA
Ps:没有template,只是用两个Primer从两端做，中间有重叠，
谢谢！
5’ hsa-pre-miR21+ T7 promoter
gaaatTAATACGACTCACTATAGG TGTCGGGTAGCTTATCAGACTGATGTTGACTGTTGAATCTCATGGC
3’ hsa-pre-miR21
TGTCAGACAGCCCATCGACTGGTGTTGCCATGAGATTCAACAGTCAAC

>hsa-mir-21 MI0000077
UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAAUCUCAUGGCAACACCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA

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1楼 2013-03-06 04:22:36

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lhs521521

新虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

你是要扩增precursor-miR-21吧，我不知道你这是怎么设计的，不过我们一般的做法是设计个逆转录引物（这个设计方法与mature-miR-21一致），然后再设计上下游real-time引物：下游引物与mature-miR-21一致，上游需要与precursor原序列的5‘端相一致（大概20多个碱基）！

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寻找真正的自我！

2楼2013-03-06 08:23:28

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