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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 新手—高斯仿真红外光谱
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飞天熊

铁虫 (初入文坛)

[求助] 新手—高斯仿真红外光谱

接触高斯几天时间，看了些教程，但总感觉不顺利。想请教论坛的大神，可不可以说下水分子的红外光谱怎么仿真，要那种图文解说的，万分感谢！！！
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1楼2013-03-05 20:31:51
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xyz7819227

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你会优化分子结构吗？会用GV生成输入文件不？如果都会的话，你的问题就解决了
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海纳百川，有容乃大
2楼2013-03-06 14:45:24
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飞天熊

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xyz7819227 at 2013-03-06 14:45:24
你会优化分子结构吗？会用GV生成输入文件不？如果都会的话，你的问题就解决了

我会有GV构建模型，优化就不会了，好像还要考虑虚频什么的，还知道优化用opt，但就是这条线连接不起来
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3楼2013-03-07 10:56:33
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xyz7819227

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zhou2009: 金币+3 2013-03-27 14:11:08
优化分子结构，并进行频率计算，确定无虚频，关键词主要opt freq就行，然后选择合适的基组，进行计算就OK。输出文件用GV打开，在result-vibration-spectrum里面可以看红外图谱，建议你把说明书或者使用指南多看看，了解了之后才能熟练的掌握。
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海纳百川，有容乃大
4楼2013-03-07 15:02:06
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飞天熊

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xyz7819227 at 2013-03-07 15:02:06
优化分子结构，并进行频率计算，确定无虚频，关键词主要opt freq就行，然后选择合适的基组，进行计算就OK。输出文件用GV打开，在result-vibration-spectrum里面可以看红外图谱，建议你把说明书或者使用指南多看看， ...

嗯，谢谢，分子的红外光谱计算好了，但还有个疑问，gaussian计算的是分子光谱，但实验测试出来的还包括像氢键之类的峰，这个可以用gaussian计算吗
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5楼2013-03-25 16:03:14
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xyz7819227

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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小红豆: 金币+50, 奖励 2013-03-27 20:36:59
引用回帖:
5楼: Originally posted by 飞天熊 at 2013-03-25 16:03:14
嗯，谢谢，分子的红外光谱计算好了，但还有个疑问，gaussian计算的是分子光谱，但实验测试出来的还包括像氢键之类的峰，这个可以用gaussian计算吗...

gaussian 计算出来的图谱里面也有氢键之类的峰啊，反正一切实验能测出来的东西高斯都能模拟出来，不能测的还能模拟出来
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海纳百川，有容乃大
6楼2013-03-25 17:37:48
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hi_2012

铁杆木虫 (知名作家)
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小红豆: 金币-49, 支付感谢金币， 2013-03-27 20:38:11
小红豆: 金币-49, 支付感谢金币 2013-03-27 20:38:40
引用回帖:
6楼: Originally posted by xyz7819227 at 2013-03-25 17:37:48
gaussian 计算出来的图谱里面也有氢键之类的峰啊，反正一切实验能测出来的东西高斯都能模拟出来，不能测的还能模拟出来...

大神！请教一下，我在做一个小分子药物的电喷雾质谱碎片裂解机理，想通过计算碎片分子的能量来推测可能的碎片及裂解的过程。这个用高斯能算出来吗？
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7楼2013-03-25 22:26:42
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飞天熊

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by xyz7819227 at 2013-03-25 17:37:48
gaussian 计算出来的图谱里面也有氢键之类的峰啊，反正一切实验能测出来的东西高斯都能模拟出来，不能测的还能模拟出来...

那氢键之类的吸收峰怎么判断呢，一般显示的都是官能团的振动，谢谢
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8楼2013-03-26 09:12:04
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xyz7819227

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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小红豆: 金币+50, 奖励 2013-03-27 20:37:16
引用回帖:
7楼: Originally posted by hi_2012 at 2013-03-25 22:26:42
大神！请教一下，我在做一个小分子药物的电喷雾质谱碎片裂解机理，想通过计算碎片分子的能量来推测可能的碎片及裂解的过程。这个用高斯能算出来吗？...

可以的，你可以先按照你自己推测的结果来进行计算，然后再分析碎片的能量与反应物的能量。而且还可以算可能发生裂解的几个部位的键的解离焓值，来判断哪个反应是最有可能发生的
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海纳百川，有容乃大
9楼2013-03-26 10:25:41
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xyz7819227

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 飞天熊 at 2013-03-26 09:12:04
那氢键之类的吸收峰怎么判断呢，一般显示的都是官能团的振动，谢谢...

一般氢键存在的部位吸收峰会增强加宽，不过这个必须要对你的物质有比较深的了解才容易判断出来。你最好看看别人有没有做过跟你类似的化合物的IR图的，看看可能出现氢键的部位在哪里，这样有针对性的看的话会比较容易看出来一些
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海纳百川，有容乃大
10楼2013-03-26 10:28:34
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