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新手—高斯仿真红外光谱
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新手—高斯仿真红外光谱
接触高斯几天时间,看了些教程,但总感觉不顺利。想请教论坛的大神,可不可以说下水分子的红外光谱怎么仿真,要那种图文解说的,万分感谢!!!
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2013-03-05 20:31:51
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感谢参与,应助指数 +1
你会优化分子结构吗?会用GV生成输入文件不?如果都会的话,你的问题就解决了
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2楼
2013-03-06 14:45:24
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2楼
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Originally posted by
xyz7819227
at 2013-03-06 14:45:24
你会优化分子结构吗?会用GV生成输入文件不?如果都会的话,你的问题就解决了
我会有GV构建模型,优化就不会了,好像还要考虑虚频什么的,还知道优化用opt,但就是这条线连接不起来
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3楼
2013-03-07 10:56:33
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zhou2009: 金币+3
2013-03-27 14:11:08
优化分子结构,并进行频率计算,确定无虚频,关键词主要opt freq就行,然后选择合适的基组,进行计算就OK。输出文件用GV打开,在result-vibration-spectrum里面可以看红外图谱,建议你把说明书或者使用指南多看看,了解了之后才能熟练的掌握。
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4楼
2013-03-07 15:02:06
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xyz7819227
at 2013-03-07 15:02:06
优化分子结构,并进行频率计算,确定无虚频,关键词主要opt freq就行,然后选择合适的基组,进行计算就OK。输出文件用GV打开,在result-vibration-spectrum里面可以看红外图谱,建议你把说明书或者使用指南多看看, ...
嗯,谢谢,分子的红外光谱计算好了,但还有个疑问,gaussian计算的是分子光谱,但实验测试出来的还包括像氢键之类的峰,这个可以用gaussian计算吗
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5楼
2013-03-25 16:03:14
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小红豆: 金币+50, 奖励
2013-03-27 20:36:59
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飞天熊
at 2013-03-25 16:03:14
嗯,谢谢,分子的红外光谱计算好了,但还有个疑问,gaussian计算的是分子光谱,但实验测试出来的还包括像氢键之类的峰,这个可以用gaussian计算吗
...
gaussian 计算出来的图谱里面也有氢键之类的峰啊,反正一切实验能测出来的东西高斯都能模拟出来,不能测的还能模拟出来
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2013-03-25 17:37:48
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小红豆: 金币-49, 支付感谢金币,
2013-03-27 20:38:11
小红豆: 金币-49, 支付感谢金币
2013-03-27 20:38:40
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xyz7819227
at 2013-03-25 17:37:48
gaussian 计算出来的图谱里面也有氢键之类的峰啊,反正一切实验能测出来的东西高斯都能模拟出来,不能测的还能模拟出来
...
大神!请教一下,我在做一个小分子药物的电喷雾质谱碎片裂解机理,想通过计算碎片分子的能量来推测可能的碎片及裂解的过程。这个用高斯能算出来吗?
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7楼
2013-03-25 22:26:42
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gaussian 计算出来的图谱里面也有氢键之类的峰啊,反正一切实验能测出来的东西高斯都能模拟出来,不能测的还能模拟出来
...
那氢键之类的吸收峰怎么判断呢,一般显示的都是官能团的振动,谢谢
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8楼
2013-03-26 09:12:04
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小红豆: 金币+50, 奖励
2013-03-27 20:37:16
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hi_2012
at 2013-03-25 22:26:42
大神!请教一下,我在做一个小分子药物的电喷雾质谱碎片裂解机理,想通过计算碎片分子的能量来推测可能的碎片及裂解的过程。这个用高斯能算出来吗?...
可以的,你可以先按照你自己推测的结果来进行计算,然后再分析碎片的能量与反应物的能量。而且还可以算可能发生裂解的几个部位的键的解离焓值,来判断哪个反应是最有可能发生的
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2013-03-26 10:25:41
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飞天熊
at 2013-03-26 09:12:04
那氢键之类的吸收峰怎么判断呢,一般显示的都是官能团的振动,谢谢...
一般氢键存在的部位吸收峰会增强加宽,不过这个必须要对你的物质有比较深的了解才容易判断出来。你最好看看别人有没有做过跟你类似的化合物的IR图的,看看可能出现氢键的部位在哪里,这样有针对性的看的话会比较容易看出来一些
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2013-03-26 10:28:34
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