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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 溶剂DMF分子中C的Ueq偏大，
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yh1311987

木虫 (正式写手)

[求助] 溶剂DMF分子中C的Ueq偏大，

溶剂DMF分子中C的Ueq偏大，导致加H后H的Ueq也大，check CIF的时候出现Large Non-Solvent  Ueq(max)/Ueq(min) ...        10.0 Ratio的错误。晶体的R值已经降到0.04了，与DMF分子中C相连的Q峰也都在1以下。请问这个怎么处理？不处理的话DMF溶剂不加H可否？
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1楼 2013-03-03 14:11:29
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08113113

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yh1311987: 金币+10 2013-03-03 17:17:27
可以对U值过大的C原子进行拆分啊，这样U值就能降下来了吧~
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2楼2013-03-03 14:27:50
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yh1311987

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 08113113 at 2013-03-03 14:27:50
可以对U值过大的C原子进行拆分啊，这样U值就能降下来了吧~

怎么拆分？谢谢
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3楼2013-03-03 17:17:13
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08113113

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yh1311987: 金币+10, 谢谢哈 2013-03-04 09:25:43
updayday: 金币+1, 感谢您的热心应助 2013-03-05 01:53:36
若使用SHELXTL就是PART 1 PART 2 PART 0那种拆分olex2就简单了，点上要拆分C原子，输入SPLIT指令，假设拆分成C1A和C1B，再输入EADP C1A C1B指令，要是键长有问题可以再限制。这样一般就差不多了。
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4楼2013-03-03 19:19:27
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hongkong1986

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
5楼2013-03-03 21:54:46
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yh1311987: 金币+10 2013-03-04 09:27:49
如果只有一个C原子那就用ISOR命令好了，溶剂分子没那么重要。
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学无止境
6楼2013-03-03 22:45:50
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yh1311987

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hongkong1986 at 2013-03-03 21:54:46
甲胺，你用它做什么呢？

我配体溶解性不好，就用DMF做溶剂长晶体了
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7楼2013-03-04 09:27:01
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yh1311987

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by cluster8676 at 2013-03-03 22:45:50
如果只有一个C原子那就用ISOR命令好了，溶剂分子没那么重要。

有5个，2个游离的DMF分子，就一个C原子U值合理的
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8楼2013-03-04 09:29:01
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ifent

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
updayday: 金币+1, 感谢您的热心应助 2013-03-05 01:54:01
yh1311987: 金币+5, 哦。谢谢了 2013-03-05 09:11:33
游离DMF热振动偏大很正常，一般强制各项异性就行，用isor。
不行就拆吧，四楼说的方法是最常用的，一般应该都没问题。
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9楼2013-03-04 17:02:09
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
yh1311987: 金币+5, 好的，谢了 2013-03-05 09:12:06
引用回帖:
8楼: Originally posted by yh1311987 at 2013-03-03 20:29:01
有5个，2个游离的DMF分子，就一个C原子U值合理的...

你如果不是要发晶体类的杂志的话，就无所谓了，我们一般就把所有溶剂分子的各向异性去掉。
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学无止境
10楼2013-03-04 22:49:12
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