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sunshine998

银虫 (小有名气)

[求助] 引物设计

新做分子的小虫,设计引物时注意到:如扩增编码区域,引物3′端不要终止于密码子的第3位,因密码子的第3位易发生简并,会影响扩增的特异性与效率。
不明白是什么意思,有明白的请告诉我呀
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新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-06 17:03:02
对引物来说3‘端的准确性最重要,而密码子的第3位易发生简并,也就是说密码子的第3位通常会变化,如果引物3′端终止于密码子的第3位,3’端错配可能较大,所以说最好避开。看你设计在哪个区了,ORF 会考虑这个问题。
2楼2013-03-05 20:39:08
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