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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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ddwy

木虫 (小有名气)

[求助] MD计算中FIELD文件包含的参数

请问,有知道MD模拟氨基酸时,FIELD文件里的atoms、constraints、angles、dihedrals、bonds、vdw相关参数怎么找到?谢谢!!
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我喜欢收集微笑没有原因……
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ddwy

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yongleli at 2013-02-23 08:03:17
1. 到自带的文件夹里,用grep命令搜索。
比如gromacs用的参数在/the path gromacs installed/share/gromacs/目录下。
2.任何一个力场参数都会以文章的形式发布。查手册,找文章。

请问,你知道MD的计算中dl_field_2.2怎么运行吗?就是输入的pdb文件要怎么写?有什么要特别注意的吗?
我喜欢收集微笑没有原因……
6楼2013-02-23 15:03:22
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-02-25 17:40:20
1. 到自带的文件夹里,用grep命令搜索。
比如gromacs用的参数在/the path gromacs installed/share/gromacs/目录下。
2.任何一个力场参数都会以文章的形式发布。查手册,找文章。

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2楼2013-02-23 08:03:17
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

1. 到自带的文件夹里,用grep命令搜索。
比如gromacs用的参数在/the path gromacs installed/share/gromacs/目录下。
2.任何一个力场参数都会以文章的形式发布。查手册,找文章。
3楼2013-02-23 08:03:24
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
ddwy: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-02-23 10:02:01
1. 到自带的文件夹里,用grep命令搜索。
比如gromacs用的参数在/the path gromacs installed/share/gromacs/目录下。
2.任何一个力场参数都会以文章的形式发布。查手册,找文章。
4楼2013-02-23 08:03:32
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