24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 641  |  回复: 7

ddwy

木虫 (小有名气)

[求助] MD计算中FIELD文件包含的参数

请问,有知道MD模拟氨基酸时,FIELD文件里的atoms、constraints、angles、dihedrals、bonds、vdw相关参数怎么找到?谢谢!!
回复此楼
我喜欢收集微笑没有原因……
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-02-25 17:40:20
1. 到自带的文件夹里,用grep命令搜索。
比如gromacs用的参数在/the path gromacs installed/share/gromacs/目录下。
2.任何一个力场参数都会以文章的形式发布。查手册,找文章。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-02-23 08:03:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

1. 到自带的文件夹里,用grep命令搜索。
比如gromacs用的参数在/the path gromacs installed/share/gromacs/目录下。
2.任何一个力场参数都会以文章的形式发布。查手册,找文章。
3楼2013-02-23 08:03:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
ddwy: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-02-23 10:02:01
1. 到自带的文件夹里,用grep命令搜索。
比如gromacs用的参数在/the path gromacs installed/share/gromacs/目录下。
2.任何一个力场参数都会以文章的形式发布。查手册,找文章。
4楼2013-02-23 08:03:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ddwy

木虫 (小有名气)

请问,你知道MD的计算中dl_field_2.2怎么运行吗?就是输入的pdb文件要怎么写?有什么要特别注意的吗?
我喜欢收集微笑没有原因……
5楼2013-02-23 15:02:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ddwy

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yongleli at 2013-02-23 08:03:17
1. 到自带的文件夹里,用grep命令搜索。
比如gromacs用的参数在/the path gromacs installed/share/gromacs/目录下。
2.任何一个力场参数都会以文章的形式发布。查手册,找文章。

请问,你知道MD的计算中dl_field_2.2怎么运行吗?就是输入的pdb文件要怎么写?有什么要特别注意的吗?
我喜欢收集微笑没有原因……
6楼2013-02-23 15:03:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ddwy at 2013-02-23 15:03:22
请问,你知道MD的计算中dl_field_2.2怎么运行吗?就是输入的pdb文件要怎么写?有什么要特别注意的吗?...

这个dl_field_2.2是什么?程序吗?没见过呀。。。。。。。
7楼2013-02-24 16:06:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ddwy

木虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by yongleli at 2013-02-23 08:03:17
1. 到自带的文件夹里,用grep命令搜索。
比如gromacs用的参数在/the path gromacs installed/share/gromacs/目录下。
2.任何一个力场参数都会以文章的形式发布。查手册,找文章。

谢谢
我喜欢收集微笑没有原因……
8楼2013-04-30 16:50:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ddwy 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +7 荷包蛋hyj 2026-03-26 7/350 2026-03-27 10:33 by edmund7
[考研] 085600,材料与化工321分,求调剂 +6 大馋小子 2026-03-27 6/300 2026-03-27 10:30 by 123h123
[考研] 求调剂323材料与化工 +7 1124361 2026-03-24 7/350 2026-03-27 10:22 by wangjy2002
[考研] 一志愿211院校 344分 东北农业大学生物学学硕,求调剂 +5 丶风雪夜归人丶 2026-03-26 6/300 2026-03-27 10:15 by barness
[考研] 287求调剂 +7 land xuxu 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:44 by wxiongid
[考研] 324求调剂 +4 wysyjs25 2026-03-21 4/200 2026-03-26 20:38 by fmesaito
[考研] 07化学280分求调剂 +8 722865 2026-03-23 8/400 2026-03-26 20:00 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿厦门大学化学学硕307求调剂 +8 y7czhao 2026-03-26 8/400 2026-03-26 19:51 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 7/350 2026-03-26 16:07 by 不吃魚的貓
[考研] 材料科学与工程 317求调剂 +4 JKSOIID 2026-03-26 4/200 2026-03-26 15:58 by 不吃魚的貓
[考研] 315分求调剂 +5 26考研上岸版26 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:11 by laoshidan
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +4 小鱼爱有机 2026-03-25 4/200 2026-03-26 10:19 by aa331100
[考研] 打过很多竞赛,085406控制工程300分,求调剂 +3 askeladz 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:08 by 给你你注意休息
[考研] 求调剂 +3 李李不服输 2026-03-25 3/150 2026-03-25 13:03 by cmz0325
[考博] 26申博自荐 +3 whh869393 2026-03-24 3/150 2026-03-24 09:55 by 21018060
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +7 vv迷 2026-03-22 7/350 2026-03-23 23:44 by Txy@872106
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 石河子大学(211、双一流)硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-20 3/150 2026-03-21 16:46 by barlinike
信息提示
请填处理意见