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牧雪长空

铜虫 (正式写手)

[求助] 求助第一性原理软件VASP中根据XDATCAR求解msd或者扩散系数的程序代码! 已有1人参与

现在根据fortran在自己编写msd,无奈水平太次了,老师编的出错。时间又紧急,所以想想向各位大侠求助。谢谢了!在分子模拟论坛上见过一些代码,比如有的是根据质心便宜求解的,有的是针对其他软件的。但是没有适合VASP的XDATCAR文件的。如果是fortran编码就最好了、
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牧雪长空

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by inuyasha001 at 2013-11-30 22:55:59
楼主,我也在为此问题焦虑,不知道您解决计算MSD的问题了没有?能否告知怎么用rings code解决这个问题呀?

其实rings code针对的是版本低一点的VASP版本,我不知道你用的是哪一版。另外,关于用rings的安装及应用,我写了一个小结,希望对你有帮助。

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  • 附件 1 : Rings安装应用小结.pdf
  • 2013-12-02 20:23:30, 422.74 K
风流自在,来去从容
3楼2013-12-02 20:23:54
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匿名

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2楼2013-11-30 22:55:59
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4楼2013-12-03 09:59:58
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牧雪长空

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by inuyasha001 at 2013-12-03 09:59:58
太感谢了!
我用的是vasp 5.2.2
现在每次运行 rings myinput都会出错,
错误为:
At line 114 of file input.f90 (unit = 9, file = 'myinput')
Fortran runtime error: Bad real number in item 2 of list  ...

input文件格式不对,你应该是input里少了一行。rings里提供的myinput模板,其中的########,这也算是一行,是需要加进去的。所以你要把这样的行,考虑进去,就是说,input模板里的注释所占的行,要考虑进去,写上。
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5楼2013-12-03 20:05:44
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6楼2013-12-05 09:23:34
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铜虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by inuyasha001 at 2013-12-05 09:23:34
果然是,我原以为那些###作为注释不起作用的。按照模板的格式弄得完全一样之后就没有这个错误了,但又来了一个新的错误:
At line 230 of file input.f90 (unit = 10, file = 'options')
Fortran runtime error: ...

end of file,我遇到的很多情况是,这个文件没被读取。你是不是把options文件的文件名改了?应该不会出现这个错误啊。我好像没碰到过。
rings软件确实不好用。你对rings的需求是什么?只是求msd吗?
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7楼2013-12-05 19:48:24
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8楼2013-12-06 14:49:58
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牧雪长空

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by inuyasha001 at 2013-12-06 14:49:58
end of file的问题解决之后,又出现内存溢出.... 我已经崩溃了... 囧
目前我是想用来计算MSD的,看情形我还是自己写程序吧 o(╯□╰)o  非常感谢您的耐心指导,等以后有空再捣鼓这个软件,rings的功能还是不错的, ...

我觉得rings这个软件做的不大好。我之前费了一两天搞定使用,发现VASP文件格式不对。放弃了,后来老板又跟我推荐,然后实打实的花了两周,发现那些华丽丽的问题,很头疼,都不想用那个软件。网上有一些编MSD的代码,你可以搜一下。
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9楼2013-12-06 21:30:42
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10楼2013-12-09 16:52:09
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