24小时热门版块排行榜    

查看: 3429  |  回复: 10
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

狼外婆

金虫 (著名写手)

[交流] diamond 如何画氢键?

diamond 作图比较简单,也容易上手。可今天鼓捣了半天也没有画出一个氢键。那位朋友知道diamond 如何画氢键?具体过程为何?

非常感谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goodluck2781

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
lingzi326(金币+3,VIP+0):非常感谢你耐心的回答^_^
你在作图的时候一般要先将没有形成氢键的氢原子“filter”掉,然后再build-create H-bond中设置氢键参数,最后点击“OK”即可。
“celerya”说得那种方法也可以找到氢键,但是有个问题,原有的共价键和现在刚生成的氢键无法自动区分,他们将均以实线出现。而上面的方法就不会出现这一问题。
另外,应用第一种方法做的氢键一般是黄色的,为了加强对比度,你可以在生成氢键之前先把原有的其他键设置成其他对比度将大的颜色,然后再操作这一步。
我个人提醒你使用第一种方法时你的cif中必须已经做好了氢键,否则只能使用第二种方法。
我知道就只有这些了,希望能对你有所帮助!
11楼2007-08-20 09:00:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

celerya

木虫 (小有名气)

diamond 3.0以上版本

★ ★ ★ ★
seasedoctor(金币+4,VIP+0):谢谢热心帮助。
build-create H-bond,出现一个对话框把你所需要的氢键数据选好之后apply now
静かな夏/铁打的硬盘流水的冰/几多天真的理想/几多找到是颓丧
2楼2007-08-16 10:19:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

celerya

木虫 (小有名气)

2

或者 build--connectivity中手动修改常见的O-H、N-H等距离到你氢键列表中的数值--connect now,这样的话 shift+ctrl+S氢键网络还可以继续拓展。
静かな夏/铁打的硬盘流水的冰/几多天真的理想/几多找到是颓丧
3楼2007-08-16 10:33:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

狼外婆

金虫 (著名写手)

谢谢兄弟,马上就去实践。非常非常感谢!
4楼2007-08-16 11:00:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 cqwQDCxMcL3I 2026-09-29 6/300 2026-09-30 16:26 by Z9YWQ5EAO3qp
[有机交流] 同一个分子,一条来自文献,一条来自AI——不告诉你答案,你会选哪条? +4 tianxiaoxian 2026-09-28 7/350 2026-09-30 08:34 by 88817753
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-29 19:27 by cqwQDCxMcL3I
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:54 by yCO1Ll7aHtsw
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:47 by yCO1Ll7aHtsw
[博后之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 16:30 by etmYJ6d2rquH
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 16:03 by etmYJ6d2rquH
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 15:46 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 15:04 by etmYJ6d2rquH
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:41 by etmYJ6d2rquH
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:30 by etmYJ6d2rquH
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:24 by etmYJ6d2rquH
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:13 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 7/350 2026-09-29 14:07 by etmYJ6d2rquH
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-29 09:49 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:42 by ZvyPK8n6Nfki
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:12 by b8fCuTHqckEt
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:15 by ez6fGg9abYaj
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-28 19:08 by 9lS3ad5oOymn
信息提示
请填处理意见