应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps deposit 粒子初始速度为0？
131/2返回列表12下一页
查看: 3953  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] lammps deposit 粒子初始速度为0？

大家新年好！
我最近在用lammps算金属表面喷涂，使用deposit命令，但是我按照说明设定了添加粒子的初速度，但是粒子速度一直为0，不运动。想请教下各位是什么原因？
我的in文件如下：
...
#Al为喷涂粒子type 2，Cu为基底 type 1，EAM势能，单位metal
...
region 4 block 0.0 72.3 0.0 72.3 210.0 225.0 side in units box  #设定添加粒子region，离基底Z方向距离20nm
...
group substrate region 1  #基底group
group al type 2    #喷涂的Al
...
compute 1 cuthermal temp
compute 2 cu temp
compute 3 al temp
compute_modify 3 dynamic yes
fix 1 substrate setforce        0        0        0  #基底fix
fix 2 cuthermal  nvt temp        300.0        300.0        10  #NVT恒温Cu
fix 3 cu  nve      #NVE恒定接触面
#fix 4 al  nve      #NVE恒定喷涂粒子，但是我尝试了有没有这条命令Al都没有运动
fix coat all deposit 10000 2 64 12345 region 4 near 5.0 vz -0.03 -0.03 units box    #deposit命令，是这有问题？

timestep   0.005  #fs
thermo     1000
thermo_style custom step temp ke pe etotal c_1 c_2 c_3
dump 1 all xyz 1000 metal.xyz
run 1000000
附图为计算结果，褐色粒子为Al，一直没有move，后续粒子一直添加到定义的region中。

谢谢大家！

1.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢
我是胖人，不是粗人
1楼 2013-02-09 04:31:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-15 08:42:55
具体的只有靠你自己去摸索， 看dump等输出，仔细琢磨。 你的模型不算复杂，应该容易实现的。

Thanks! I will test it in the following days.
赞一下(1人) 回复此楼
我是胖人，不是粗人
7楼2013-02-15 23:54:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-15 08:42:55
具体的只有靠你自己去摸索， 看dump等输出，仔细琢磨。 你的模型不算复杂，应该容易实现的。

请问喷涂粒子的group的该怎么定义？我用type或者region之类的定义，产生初始喷涂粒子group的粒子数为0，最终导致粒子不能运动。
赞一下(1人) 回复此楼
我是胖人，不是粗人
8楼2013-02-16 06:02:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)
总结一下，
fix coat all deposit ......
不能对all进行fix，只能对喷涂粒子group进行fix，这样喷涂粒子就能单独积分运动了。
赞一下(1人) 回复此楼
我是胖人，不是粗人
9楼2013-02-16 06:17:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
paladinlee: 金币+70, ★★★很有帮助, 10 2013-02-14 01:11:43
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-02-16 10:45:01
dump出原子速度看看？
赞一下 回复此楼
2楼2013-02-13 17:47:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-13 17:47:07
dump出原子速度看看？

dump 喷涂粒子有初速度，但是不运动？怎么回事？
赞一下 回复此楼
我是胖人，不是粗人
3楼2013-02-14 01:11:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ddll_slsl

木虫 (正式写手)
有初速度， 下一步骤的速度呢？
看看原子坐标， 有小小移动吗？
受力情况如何？
赞一下 回复此楼
4楼2013-02-14 09:02:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
zh1987hs: 金币+2, 鼓励交流 2013-02-16 10:45:26
引用回帖:
4楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-14 09:02:30
有初速度， 下一步骤的速度呢？
看看原子坐标， 有小小移动吗？
受力情况如何？

下一步还是保持原速度，粒子位置没动。
估计是粒子运动积分的group定义有问题。即（fix 4 al  nve）。但是我看说明没有要用到命令积分运动方程啊？
有没有什么方法让喷涂粒子的运动速度保持初速度，然后喷到基底表面的阶段半径内相互作用？
PS：如果对所有粒子all进行NVE积分的话，喷涂粒子有运动，但是运动太剧烈了，并且大部分在insert 的空间内运动，体系温度很高10000K...
赞一下 回复此楼
我是胖人，不是粗人
5楼2013-02-14 23:41:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ddll_slsl

木虫 (正式写手)
具体的只有靠你自己去摸索， 看dump等输出，仔细琢磨。 你的模型不算复杂，应该容易实现的。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

paladinlee
6楼2013-02-15 08:42:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ddll_slsl

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by paladinlee at 2013-02-16 06:02:15
请问喷涂粒子的group的该怎么定义？我用type或者region之类的定义，产生初始喷涂粒子group的粒子数为0，最终导致粒子不能运动。...

可以用不同的原子或分子类型。
赞一下 回复此楼
10楼2013-02-16 21:01:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 paladinlee 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 5/250 2026-08-23 04:07 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:31 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +3 简单化xn 2026-08-22 7/350 2026-08-22 19:46 by 简单化xn
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭