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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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026li

金虫 (小有名气)


[交流] Pd(100)吸附 CO G09

用G09计算Pd在100晶面上吸附CO,采用的是上层9个原子,下层4个原子的cluster模型,在吸附中Pd原子的结晶学位置固定,优化产生两个问题:
1. 优化好的结构,单独算freq。总是不收敛,几遍是收敛也会产生连个虚频,-810和-270. 其中-810是CO的C在晶面上的摆动,-270是Pd原子的振动。尝试用Gview消虚频,但是不收敛。请问如何消除这样的虚频?
2.如果不固定原子的坐标优化,不能保持Pd的结构,做这种吸附正确的方法是怎么做的?请大家给点意见。
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026li

金虫 (小有名气)


补充一个问题:看到很多文献计算这种吸附都是采用MS和VASP的软件来做,周期性边界条件建模,那用G09算cluster不可行吗?
2楼2013-02-05 16:57:31
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275560060

金虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cenwanglai: 金币+2, 谢谢回复~ 2013-02-06 19:22:32
026li: 金币+3 2013-02-06 20:26:56
我觉得采用团簇模型也是可以的,但你的表面原子给的太少了,不能反应表面性质。另外,既然固定Pt原子,又去计算全局的频率这不是个矛盾吗?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

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3楼2013-02-06 15:20:39
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026li

金虫 (小有名气)


送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 275560060 at 2013-02-06 15:20:39
我觉得采用团簇模型也是可以的,但你的表面原子给的太少了,不能反应表面性质。另外,既然固定Pt原子,又去计算全局的频率这不是个矛盾吗?

我是先固定优化,然后算单点的频率,这时Pd原子有虚频,吸附C=O也有虚频,请教一下,我该怎么办呢?
4楼2013-02-06 20:26:47
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yanrding

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
"尝试用Gview消虚频,但是不收敛。"
这个不能作为虚频消不掉的理由,你得想办法让它收敛。

另外,查一下freq里面的关键字atoms,看是否有用。
The keywords atoms and notatoms can be used to define an atom list whose modes should be included/excluded (respectively).
5楼2013-02-06 21:28:58
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meteoric30

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
026li: 金币+3 2013-02-07 08:42:03
cenwanglai: 金币+2, ~ 2013-02-07 22:59:30
本来用g算晶面问题本身就有问题,不过有相关的文献,边界等效应太明显了,计算时间也长,楼主为什么不用vasp等。如果非要用g,模型是主要的问题。
6楼2013-02-07 00:17:32
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026li

金虫 (小有名气)


引用回帖:
6楼: Originally posted by meteoric30 at 2013-02-07 00:17:32
本来用g算晶面问题本身就有问题,不过有相关的文献,边界等效应太明显了,计算时间也长,楼主为什么不用vasp等。如果非要用g,模型是主要的问题。

因为组里只有G09,技术问题,只能用G09来做。
7楼2013-02-07 08:41:57
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