应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » Pd（100）吸附 CO G09
71/1返回列表
查看: 1185  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

026li

金虫 (小有名气)

[交流] Pd（100）吸附 CO G09

用G09计算Pd在100晶面上吸附CO，采用的是上层9个原子，下层4个原子的cluster模型，在吸附中Pd原子的结晶学位置固定，优化产生两个问题：
1. 优化好的结构，单独算freq。总是不收敛，几遍是收敛也会产生连个虚频，-810和-270. 其中-810是CO的C在晶面上的摆动，-270是Pd原子的振动。尝试用Gview消虚频，但是不收敛。请问如何消除这样的虚频？
2.如果不固定原子的坐标优化，不能保持Pd的结构，做这种吸附正确的方法是怎么做的？请大家给点意见。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-02-05 16:55:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

026li

金虫 (小有名气)
补充一个问题：看到很多文献计算这种吸附都是采用MS和VASP的软件来做，周期性边界条件建模，那用G09算cluster不可行吗？
赞一下 回复此楼
2楼2013-02-05 16:57:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

275560060

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
cenwanglai: 金币+2, 谢谢回复~ 2013-02-06 19:22:32
026li: 金币+3 2013-02-06 20:26:56
我觉得采用团簇模型也是可以的，但你的表面原子给的太少了，不能反应表面性质。另外，既然固定Pt原子，又去计算全局的频率这不是个矛盾吗？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

026li
3楼2013-02-06 15:20:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

026li

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 275560060 at 2013-02-06 15:20:39
我觉得采用团簇模型也是可以的，但你的表面原子给的太少了，不能反应表面性质。另外，既然固定Pt原子，又去计算全局的频率这不是个矛盾吗？

我是先固定优化，然后算单点的频率，这时Pd原子有虚频，吸附C=O也有虚频，请教一下，我该怎么办呢？
赞一下 回复此楼
4楼2013-02-06 20:26:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanrding

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
"尝试用Gview消虚频，但是不收敛。"
这个不能作为虚频消不掉的理由，你得想办法让它收敛。

另外，查一下freq里面的关键字atoms，看是否有用。
The keywords atoms and notatoms can be used to define an atom list whose modes should be included/excluded (respectively).
赞一下 回复此楼
5楼2013-02-06 21:28:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meteoric30

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
026li: 金币+3 2013-02-07 08:42:03
cenwanglai: 金币+2, ~ 2013-02-07 22:59:30
本来用g算晶面问题本身就有问题，不过有相关的文献，边界等效应太明显了，计算时间也长，楼主为什么不用vasp等。如果非要用g，模型是主要的问题。
赞一下 回复此楼
6楼2013-02-07 00:17:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

026li

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by meteoric30 at 2013-02-07 00:17:32
本来用g算晶面问题本身就有问题，不过有相关的文献，边界等效应太明显了，计算时间也长，楼主为什么不用vasp等。如果非要用g，模型是主要的问题。

因为组里只有G09，技术问题，只能用G09来做。
赞一下 回复此楼
7楼2013-02-07 08:41:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 026li 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-28 16:06 by winsaint
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[职场人生] 学生撞见辅导员送外卖，第二天全班都沉默了 +3 鲸鱼融金_浙江_� 2026-08-22 3/150 2026-08-26 09:01 by zzuzxg
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭