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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 两个基因40%同源性说明什么
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shengzike

银虫 (小有名气)

[求助] 两个基因40%同源性说明什么

在Pubmed-gene里查到，我的目的基因在E.coli中居然是和核糖体小亚基中编码S4蛋白的基因（rpsD）是同一个基因，rpsD有621bp。而我的目的基因在其他种类细菌（如肺克）中的序列只有300多bp，该基因与rpsD的同源性为40%多（用DNAman软件算的）。我的目的基因在其他菌种中的同源性为80%左右。当然，在其他菌种中，我的目的基因与编码S4的基因不是同一个基因。不知道该如何理解我的目的基因在E.coli中与rpsD是同一个基因，我可以理解为S4蛋白与我的目的基因编码的蛋白有什么关联吗？请高人指点，谢谢！
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1楼 2013-01-25 08:53:21
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cxt86

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我觉得是不是没有计算空位啊？也就是说600多bp和300多pb在DNAman里计算同源性，最多也就50%了，再去掉不一样的碱基就40%了
同源基因在不用物种中具有不同功能也正常啊
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5楼2013-01-25 15:18:37
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zhang881007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这说明了你的基因的可能进化途径
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shengzike
shine
2楼2013-01-25 08:56:02
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shengzike

银虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhang881007 at 2013-01-25 08:56:02
这说明了你的基因的可能进化途径

能否详细点呢，谢谢！
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3楼2013-01-25 09:09:52
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
楼主已经说“我的目的基因在E.coli中居然是和核糖体小亚基中编码S4蛋白的基因（rpsD）是同一个基因，”，又问，如何理解二者的关系。。。。。。
是同一个基因很正常啊，亲缘关系很近的不同物种在基因水平上存在共线性是很好理解的啊。。。。。
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4楼2013-01-25 10:46:37
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