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blacksky00

银虫 (著名写手)

[求助] diamond画四面体显示不全

用diamond画晶体的四面体时，有一个四面体显示不全（如图），如何解决呢？另外图片右边那些残缺的四面体如何批量删除呢？
另外：build>fill>unit cell,这选项是灰色的，怎么样才能改变晶胞的大小呢？
晶体的cif文件已上传，谢谢！
未命名.jpg

[ Last edited by blacksky00 on 2013-1-24 at 14:25 ]
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    • 2013-01-24 14:18:54, 2.12 K

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1楼 2013-01-24 14:22:35
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ifent

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
blacksky00: 金币+5, ★有帮助, 谢谢你的建议，这次我已经全部折腾好了！但估计一个月之后又不会折腾了！ 2013-01-24 16:39:13
我以前也遇到过画完少一个面的，重画有可能就好了，另外你的面的假原子如果和本身的原子有重叠，有可能显示不出来面。 你用build>fill>range, 就可以改你所谓的晶胞的大小了（当然晶胞的大小是不能改的）。
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2楼2013-01-24 16:31:17
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blacksky00

银虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ifent at 2013-01-24 16:31:17
我以前也遇到过画完少一个面的，重画有可能就好了，另外你的面的假原子如果和本身的原子有重叠，有可能显示不出来面。 你用build>fill>range, 就可以改你所谓的晶胞的大小了（当然晶胞的大小是不能改的）。

谢谢！
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3楼2013-01-24 16:37:59
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blacksky00

银虫 (著名写手)
谢谢关注的虫子们！6个晶体的结构已经全部折腾好了，现在已经填进了博士论文中，等下就去打印装订了！
简述下我的折腾方法：
问题1：R-Max改成3.8，就可以不上那个角了。图上是3.5，所以缺了一个角；但图中4组多面体中的键长应该是相等的，为啥那个就给改成3.8才行呢？
对于其它的5个晶体，也是采用同样的方法，即调整RMax的值，或者选择合适的配位原子（图中只选了O，有两个晶体中要同时选上Cl）
问题2：先调整图的方向，使不需要的原子尽量落在一个矩形框内，可以一次选中删除；要是不在一个矩形框中，就多选几次，分开删除。
问题3: 在tools里面，选择reset setttings后，再重新打开，发现build>fill下面的命令全部可以用了。
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4楼2013-01-24 16:49:28
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