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blacksky00

银虫 (著名写手)

[求助] diamond画四面体显示不全

用diamond画晶体的四面体时,有一个四面体显示不全(如图),如何解决呢?另外图片右边那些残缺的四面体如何批量删除呢?
另外:build>fill>unit cell,这选项是灰色的,怎么样才能改变晶胞的大小呢?
晶体的cif文件已上传,谢谢!
未命名.jpg

[ Last edited by blacksky00 on 2013-1-24 at 14:25 ]
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  • 2013-01-24 14:18:54, 2.12 K

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ifent

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
blacksky00: 金币+5, 有帮助, 谢谢你的建议,这次我已经全部折腾好了!但估计一个月之后又不会折腾了! 2013-01-24 16:39:13
我以前也遇到过画完少一个面的,重画有可能就好了,另外你的面的假原子如果和本身的原子有重叠,有可能显示不出来面。 你用build>fill>range, 就可以改你所谓的晶胞的大小了(当然晶胞的大小是不能改的)。
2楼2013-01-24 16:31:17
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blacksky00

银虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ifent at 2013-01-24 16:31:17
我以前也遇到过画完少一个面的,重画有可能就好了,另外你的面的假原子如果和本身的原子有重叠,有可能显示不出来面。 你用build>fill>range, 就可以改你所谓的晶胞的大小了(当然晶胞的大小是不能改的)。

谢谢!
3楼2013-01-24 16:37:59
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blacksky00

银虫 (著名写手)

谢谢关注的虫子们!6个晶体的结构已经全部折腾好了,现在已经填进了博士论文中,等下就去打印装订了!
简述下我的折腾方法:
问题1:R-Max改成3.8,就可以不上那个角了。图上是3.5,所以缺了一个角;但图中4组多面体中的键长应该是相等的,为啥那个就给改成3.8才行呢?
对于其它的5个晶体,也是采用同样的方法,即调整RMax的值,或者选择合适的配位原子(图中只选了O,有两个晶体中要同时选上Cl)
问题2:先调整图的方向,使不需要的原子尽量落在一个矩形框内,可以一次选中删除;要是不在一个矩形框中,就多选几次,分开删除。
问题3: 在tools里面,选择reset setttings后,再重新打开,发现build>fill下面的命令全部可以用了。
4楼2013-01-24 16:49:28
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