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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 组织蛋白酶Ｌ的空腔
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jluyxy

金虫 (小有名气)

[求助] 组织蛋白酶Ｌ的空腔

请问组织蛋白酶L的S2,S3口袋分别是由哪几个氨基酸残基构成的啊
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    • 2013-01-23 15:14:06, 186.44 K

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1楼 2013-01-23 15:15:19
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jluyxy: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-01-23 19:03:46
zh1987hs: 金币+3, jiao版是VMD控啊~哈哈 2013-01-26 17:39:17
求赐教和为S2,S3口袋？

下图是使用VMD 观看你附件里的图像显示，如果你能直接看出来S2,S3口袋 的话，你可以在VMD 中把这个口袋选择出来

set sel [atomselect top "S2,S3口袋"]
$sel get resname
$sel get resid
选择出来之后就可以使用两个 get 命令把这些氨基酸选出来了。

或者你可以试试根据二级结构来求啊。
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2楼2013-01-23 16:01:15
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-01-23 16:01:15
求赐教和为S2,S3口袋？

下图是使用VMD 观看你附件里的图像显示，如果你能直接看出来S2,S3口袋 的话，你可以在VMD 中把这个口袋选择出来

set sel
$sel get resname
$sel get resid
选择出来之后就可以使用 ...

atomselect top "S2,S3口袋"]
不能输入汉字吧？请指教
赞一下 回复此楼
为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
3楼2013-01-25 21:36:23
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 游子8921 at 2013-01-25 21:36:23
atomselect top "S2,S3口袋"]
不能输入汉字吧？请指教...

哈哈哈，当然不能输入汉字，你去看一下VMD 的手册
赞一下 回复此楼
4楼2013-01-25 21:44:40
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