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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 碱基偏好性
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thinkerboy

铁虫 (小有名气)

[交流] 碱基偏好性

我想利用氨基酸序列比对，然后设计简并引物，现在我想找物种对碱基的偏好性以减少我的引物中的简并的碱基，我做的是鸡的基因，请问哪可以找到鸡对碱基的偏好性。
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1楼 2013-01-20 15:27:51
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
不是碱基偏好性，应该是密码子偏好吧。至于你做是物种，查相关文献或者google应该可以找到。不过即使非稀有密码子，还是有简并的问题。
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3楼2013-01-21 05:23:36
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小猫三两只

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
http://www.kazusa.or.jp/codon/
这个是密码子偏好性网站，可以参考下，我平时做同源克隆都是利用这个网站的密码子偏好性来设计引物。
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4楼2013-01-21 10:01:55
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csdyg

木虫 (正式写手)
楼上正解
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5楼2013-01-23 04:17:38
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简单回复
yingying15882楼
2013-01-20 18:29   回复  
thinkerboy(金币+1): 谢谢参与
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