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thinkerboy

铁虫 (小有名气)


[交流] 碱基偏好性

我想利用氨基酸序列比对,然后设计简并引物,现在我想找物种对碱基的偏好性以减少我的引物中的简并的碱基,我做的是鸡的基因,请问哪可以找到鸡对碱基的偏好性。
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不是碱基偏好性,应该是密码子偏好吧。至于你做是物种,查相关文献或者google应该可以找到。不过即使非稀有密码子,还是有简并的问题。
3楼2013-01-21 05:23:36
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小猫三两只

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
http://www.kazusa.or.jp/codon/
这个是密码子偏好性网站,可以参考下,我平时做同源克隆都是利用这个网站的密码子偏好性来设计引物。
4楼2013-01-21 10:01:55
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csdyg

木虫 (正式写手)


楼上正解
5楼2013-01-23 04:17:38
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简单回复
2013-01-20 18:29   回复  
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