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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 处理效果强弱顺序CT值和2^(-△△Ct)不匹配
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tmdabc

金虫 (小有名气)

[求助] 处理效果强弱顺序CT值和2^(-△△Ct)不匹配

0        1.446666667        0.873333        1.296666667               ：减去空白对照
                                      
        1        0.366868091        0.545884132        0.407065634       ： 2^(-△△Ct)
問題        ：
处理效果强弱顺序CT值和2^(-△△Ct)不匹配-----因为drug的△△Ct结果在0-1，
怎么办？
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1楼 2013-01-19 22:14:53
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不匹配是什么意思？你的意思是用药物处理后目的基因表达下调了？原本是应该上调？
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2楼2013-01-20 01:25:29
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tmdabc

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-20 01:25:29
不匹配是什么意思？你的意思是用药物处理后目的基因表达下调了？原本是应该上调？

处理效果强弱顺序：
CT值：abcd
2^(-△△Ct)：adcb
明白了吗？
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3楼2013-01-20 04:02:33
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by tmdabc at 2013-01-20 04:02:33
处理效果强弱顺序：
CT值：abcd
2^(-△△Ct)：adcb
明白了吗？...

你的2^(-△△Ct)是怎么来的？第一个△是内参的变化把。应该可以直接2^(-△Ct)看处理效果。
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4楼2013-01-20 04:52:44
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tmdabc

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-20 04:52:44
你的2^(-△△Ct)是怎么来的？第一个△是内参的变化把。应该可以直接2^(-△Ct)看处理效果。...

但是，2^(-△Ct)结果进行强弱排序，和CT值直接排序是矛盾的啊。因为第三个数据delta T＜1，其他两个大于一，
怎么办？
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5楼2013-01-20 05:54:53
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

如果可以做重复的话就可以解决问题了吧。如果实在不能再做的话就用前面两个呗。但是这个结论可能不是很保险哦。
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6楼2013-01-20 06:32:04
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tmdabc

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-20 06:32:04
如果可以做重复的话就可以解决问题了吧。如果实在不能再做的话就用前面两个呗。但是这个结论可能不是很保险哦。

您这是？
不一样的处理，怎么舍掉？
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7楼2013-01-20 15:42:08
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你各个样品的Ct值大小跟你取多少样品进行realtimer PCR直接相关，楼主有没有想过如何去消除各样品加样造成的误差，因为你没有内参来消除加样误差。或者你是否考虑过用绝对定量来做？
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
8楼2013-01-20 19:28:33
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tmdabc

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by gyesang at 2013-01-20 19:28:33
你各个样品的Ct值大小跟你取多少样品进行realtimer PCR直接相关，楼主有没有想过如何去消除各样品加样造成的误差，因为你没有内参来消除加样误差。或者你是否考虑过用绝对定量来做？

问题是内参就是0，不管用什么去作内参，只要不污染就不可能有东西啊
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9楼2013-01-20 20:13:50
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lushuiw

银虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by tmdabc at 2013-01-20 20:13:50
问题是内参就是0，不管用什么去作内参，只要不污染就不可能有东西啊...

内参怎么会是0呢？不解
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10楼2013-01-20 21:24:08
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