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[求助] sybyl-x能量优化和clogP 求助谢谢！

sybyl-x能量优化之后吡啶环怎么变形类似5元环了呢，如图示（不是角度问题）
还有用分子表单计算clogP和极性表面积时，要先把化合物能量优化吗？谢谢！

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1楼 2013-01-19 21:57:34

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药物设计

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【答案】应助回帖

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chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-01-21 08:23:38
啄木鸟NO.1: 金币+10 2013-03-19 15:36:59

吡啶环请注意原子的原子类型，C为C2 or Car，N为N2或者Nar。

ClogP无需优化结构，但PSA的计算是考虑了三维结构的算法，因此需要优化。

2楼2013-01-20 15:09:46

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