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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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啄木鸟NO.1

金虫 (正式写手)

[求助] sybyl-x能量优化 和clogP 求助 谢谢!

sybyl-x能量优化之后吡啶环怎么变形类似5元环了呢,如图示(不是角度问题)
还有用分子表单计算clogP和极性表面积时,要先把化合物能量优化吗?谢谢!

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-01-21 08:23:38
啄木鸟NO.1: 金币+10 2013-03-19 15:36:59
吡啶环 请注意原子的原子类型,C为C2 or Car,N为N2或者Nar。

ClogP无需优化结构,但PSA的计算是考虑了三维结构的算法,因此需要优化。
2楼2013-01-20 15:09:46
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