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一声叹息010木虫 (小有名气)
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[交流]
搭建正二十面体金属团簇 已有28人参与
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由于某些原因, 我想搭建一些金属团簇,过程真的有些曲折,我都准备写个小脚本计算空间坐标了 。幸好发现了剑桥大学团簇库,可以直接获得团簇的原子坐标。 http://www-wales.ch.cam.ac.uk/CCD.html 比如,我想得到包含147个Au原子的正二十面体。 复制所有坐标,新建一个Excel表格, 将坐标粘贴到B3单元格:点右键-->选择性粘贴-->无格式文本。然后在A1单元格输入原子数,如此例中的147;在A3单元格输入元素符号,如此例中的Au,通过向下拖动A3单元格快速复制Au;在A2单元格随便写点东西方便回顾,可以不写; 文件-->另存为,另存为.txt格式的文本文件 大部分计算软件都可以读取.xyz格式的文件,比如Materials Studio 点击右键,改变一下显示方式 居然没有金属键,Build一下的默认值就有了:Build-->Bonds 如果出现跨原子的长程键,显然就不合适了,就稍微调调两个滑块 最后,点击clean按钮,使结构合理一些(因为我们之前是套用的Al原子坐标) [ Last edited by 一声叹息010 on 2013-1-19 at 20:44 ] |
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2楼2013-01-19 21:26:38
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3楼2013-01-19 21:29:21
一声叹息010
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10楼2013-01-20 21:36:49













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leilei024542
