| 查看: 8525 | 回复: 40 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
一声叹息010木虫 (小有名气)
|
[交流]
搭建正二十面体金属团簇 已有28人参与
|
||
由于某些原因， 我想搭建一些金属团簇，过程真的有些曲折，我都准备写个小脚本计算空间坐标了 。幸好发现了剑桥大学团簇库，可以直接获得团簇的原子坐标。 http://www-wales.ch.cam.ac.uk/CCD.html 比如，我想得到包含147个Au原子的正二十面体。      复制所有坐标，新建一个Excel表格， 将坐标粘贴到B3单元格：点右键-->选择性粘贴-->无格式文本。然后在A1单元格输入原子数，如此例中的147；在A3单元格输入元素符号，如此例中的Au，通过向下拖动A3单元格快速复制Au；在A2单元格随便写点东西方便回顾，可以不写；  文件-->另存为，另存为.txt格式的文本文件   大部分计算软件都可以读取.xyz格式的文件，比如Materials Studio  点击右键，改变一下显示方式   居然没有金属键，Build一下的默认值就有了：Build-->Bonds  如果出现跨原子的长程键，显然就不合适了，就稍微调调两个滑块 最后，点击clean按钮，使结构合理一些（因为我们之前是套用的Al原子坐标）  [ Last edited by 一声叹息010 on 2013-1-19 at 20:44 ] |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
leilei024542» 猜你喜欢
086502化学工程342求调剂
已经有4人回复
-
材料求调剂一志愿哈工大324
已经有7人回复
-
328求调剂
已经有7人回复
-
340求调剂
已经有5人回复
-
一志愿南昌大学324求调剂
已经有4人回复
-
求调剂推荐 材料 304
已经有15人回复
-
291求调剂
已经有19人回复
-
331环境科学与工程求调剂
已经有3人回复
-
289求调剂
已经有8人回复
-
315分求调剂
已经有7人回复
41楼2020-02-10 12:42:04
杨寻
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 7081.1
- 散金: 29
- 红花: 4
- 帖子: 1146
- 在线: 367小时
- 虫号: 952321
- 注册: 2010-02-04
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2013-01-19 21:26:38
杨寻
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 7081.1
- 散金: 29
- 红花: 4
- 帖子: 1146
- 在线: 367小时
- 虫号: 952321
- 注册: 2010-02-04
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
3楼2013-01-19 21:29:21
一声叹息010
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1552.1
- 红花: 7
- 帖子: 91
- 在线: 110.8小时
- 虫号: 1502781
- 注册: 2011-11-21
- 专业: 理论和计算化学
10楼2013-01-20 21:36:49
