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xiaozufeng

金虫 (正式写手)

[交流] IRC计算求助

各位，请教个问题：
最近在做过渡态结构，只是用scan扫描，找到一个结构，其虚频正好对应我要的H转移过程，请问下这个结构作为过渡态可靠不？另外基于这个结构做了IRC计算，其结果见下图。从GaussView上看，曲线两端的结构仍然对应着反应物，请问这该如何解决？

R2-c1-mol-cys-enol3-g03-high-scan-try4-scan4-58optfrezed2IRC.jpg
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1楼 2013-01-15 19:35:32
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gauss98

禁虫 (正式写手)
★
xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽
2楼2013-01-16 08:28:01
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userhung

禁虫 (文学泰斗)
★
xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
应该就是这个样子的~~~~~~~~~~~~
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3楼2013-01-16 09:07:33
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xiaozufeng

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by userhung at 2013-01-16 09:07:33
应该就是这个样子的~~~~~~~~~~~~

IRC曲线上两个端点都对应着反应物，这怎么弄呢？
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6楼2013-01-16 09:15:42
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yxj1986111

金虫 (小有名气)
★
xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
建议再找找过渡态
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7楼2013-01-16 09:22:56
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sujialing

木虫 (小有名气)
★
xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
你的过渡态找的不太好吧，我也在过渡态的我的 没有出现过这种情况，建议你做IRC分析的采用分步的即foreward 和reverse分开做然后再观察是否从过渡态可以得到反应物和产物。
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8楼2013-01-16 09:35:04
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xiaozufeng

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by sujialing at 2013-01-16 09:35:04
你的过渡态找的不太好吧，我也在过渡态的我的 没有出现过这种情况，建议你做IRC分析的采用分步的即foreward 和reverse分开做然后再观察是否从过渡态可以得到反应物和产物。

之前也做了forward和reverse，结果跟单独的IRC是一样的，现在不知道怎么收场了
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10楼2013-01-16 10:54:41
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sujialing

木虫 (小有名气)
那可能真的是你的过渡态有问题了，再重新找一下过渡态吧，还有就是有时候做IRC分析并不能完全达到我们想要的，可能只是结构类似这时候也认为过渡态是对的。
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11楼2013-01-16 11:31:19
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简单回复
茅塞顿开4楼
2013-01-16 09:09   回复  
xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
wgatssd5楼
2013-01-16 09:10   回复  
xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
533499279楼
2013-01-16 09:45   回复  
xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
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