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xiaozufeng

金虫 (正式写手)


[交流] IRC计算求助

各位,请教个问题:
最近在做过渡态结构,只是用scan扫描,找到一个结构,其虚频正好对应我要的H转移过程,请问下这个结构作为过渡态可靠不?另外基于这个结构做了IRC计算,其结果见下图。从GaussView上看,曲线两端的结构仍然对应着反应物,请问这该如何解决?

R2-c1-mol-cys-enol3-g03-high-scan-try4-scan4-58optfrezed2IRC.jpg
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gauss98

禁虫 (正式写手)


xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽

2楼2013-01-16 08:28:01
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userhung

禁虫 (文学泰斗)



xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
应该就是这个样子的~~~~~~~~~~~~
3楼2013-01-16 09:07:33
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xiaozufeng

金虫 (正式写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by userhung at 2013-01-16 09:07:33
应该就是这个样子的~~~~~~~~~~~~

IRC曲线上两个端点都对应着反应物,这怎么弄呢?
6楼2013-01-16 09:15:42
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yxj1986111

金虫 (小有名气)



xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
建议再找找过渡态
7楼2013-01-16 09:22:56
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sujialing

木虫 (小有名气)



xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
你的过渡态找的不太好吧,我也在过渡态的我的 没有出现过这种情况,建议你做IRC分析的采用分步的即foreward 和reverse分开做然后再观察是否从过渡态可以得到反应物和产物。
8楼2013-01-16 09:35:04
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xiaozufeng

金虫 (正式写手)


引用回帖:
8楼: Originally posted by sujialing at 2013-01-16 09:35:04
你的过渡态找的不太好吧,我也在过渡态的我的 没有出现过这种情况,建议你做IRC分析的采用分步的即foreward 和reverse分开做然后再观察是否从过渡态可以得到反应物和产物。

之前也做了forward和reverse,结果跟单独的IRC是一样的,现在不知道怎么收场了
10楼2013-01-16 10:54:41
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sujialing

木虫 (小有名气)


那可能真的是你的过渡态有问题了,再重新找一下过渡态吧,还有就是有时候做IRC分析并不能完全达到我们想要的,可能只是结构类似这时候也认为过渡态是对的。
11楼2013-01-16 11:31:19
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2013-01-16 09:09   回复  
xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
wgatssd5楼
2013-01-16 09:10   回复  
xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
533499279楼
2013-01-16 09:45   回复  
xiaozufeng(金币+1): 谢谢参与
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