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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白质结构域的分析
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遥望87

银虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质结构域的分析

已知一个基因的蛋白质序列，怎样分析其自身的特性。谢谢！
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夜空中最亮的星！
1楼2013-01-14 00:45:14
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zzl2516

金虫 (小有名气)
你具体要做什么呢
可以试试interproscan
http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/
或者SCOP http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/
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4楼2013-01-14 10:48:45
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
遥望87: 金币+5, ★有帮助, 谢谢！ 2013-01-14 08:27:56
自身特性这个范围是否太宽了？你想具体分析什么？保守的结构域可以在NCBI上查（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd）。
很多bioinformatics线上预测
http://au.expasy.org/tools/
http://www.cbs.dtu.dk/services/
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2楼2013-01-14 03:25:31
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
遥望87: 金币+5, ★有帮助, 谢谢！ 2013-01-14 08:28:11
你都说了结构域分析，那看看pfam, prints等二级结构数据库
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3楼2013-01-14 07:16:55
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遥望87

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zzl2516 at 2013-01-14 10:48:45
你具体要做什么呢
可以试试interproscan
http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/
或者SCOP http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/

谢谢！
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夜空中最亮的星！
5楼2013-01-15 17:12:59
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