24小时热门版块排行榜    

查看: 9181  |  回复: 12

兔子lizzy

金虫 (小有名气)

[求助] 如何计算静电势ESP以及作图

这是论文原文 ,原图见附件。。。。没做过静电势ESP,请问如何用高斯算,再用什么软件作图?
3.3. Electronic Static Potential. The high oxidation potential
of sulfone molecules indicates great difficulty in removing an
electron from the molecules containing a highly polar sulfone
group. Electronic static potential (ESP) is commonly utilized to
display the polarity and stability of molecules. ESP mapped on
the isosurface (0.001 au) of electronic density of EMES (as a
representative of the ether-functionalized sulfone solvent) was
plotted in Figure 10. The very negative electrostatic potential on
the sulfone oxygen (43.5 kcal/mol) and two strong positive
electrostatic potential areas along the extension of the oxygen
sulfur covalent bonds (31.2 kcal/mol) lead to a large polarity,
which can be explained by the concept of σ-hole. The large
polarity of the sulfone group also helps dissolve the Li salt and
the high cathodic stability.

ESP.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

mu00mu8

银虫 (初入文坛)

使用Gaussian完成计算,保存*.chk文件;
用GaussView打开*.chk,从Results中选Surfaces,打开Surfaces and Cubes对话框,选取Cube Actions中的New Cube,从Kind中选取Total Density,然后点OK。选取Surface Actions中的New Mapped Surface,OK。出图。然后改下Display Format就出来楼主要的图了。
5楼2013-01-13 23:08:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

绘制静电势图只需要优化后构型后得到chk文件就可以了。
在版内搜搜吧,很多专家都讨论过。
喂人民服雾。
2楼2013-01-11 11:51:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六世之爱

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

哦,忘记说了,二楼说的很对,你如果想计算ESP的话,拿到优化后的chk文件直接用multiwfn就可以计算了。
4楼2013-01-11 15:55:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

六世之爱

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
兔子lizzy: 金币+5 2013-01-11 17:57:14
兔子lizzy: 金币+5 2013-01-13 09:02:07
推荐使用mutiwfn,你帖子里的图用这个软件就可以做出来,很漂亮。
3楼2013-01-11 15:54:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六世之爱

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by mu00mu8 at 2013-01-13 23:08:18
使用Gaussian完成计算,保存*.chk文件;
用GaussView打开*.chk,从Results中选Surfaces,打开Surfaces and Cubes对话框,选取Cube Actions中的New Cube,从Kind中选取Total Density,然后点OK。选取Surface Action ...

ESP不等于total density吧
6楼2013-01-15 12:47:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六世之爱

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
小的谢谢楼主打赏,给楼主请安了
7楼2013-01-15 12:47:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mu00mu8

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 六世之爱 at 2013-01-15 12:47:02
ESP不等于total density吧...

New Mapped Surface时选取的是ESP。Total Density是生成cube时的选项。具体的原理我也不太懂,不过小木虫上的其他人是这么做的。没有用过mutiwfn,不知道mutiwfn做出来的图什么样,不过根据我做过的ESP的图来看,楼主的这个图像很像是拿GV做出来的。
8楼2013-01-15 15:45:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六世之爱

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by mu00mu8 at 2013-01-15 15:45:16
New Mapped Surface时选取的是ESP。Total Density是生成cube时的选项。具体的原理我也不太懂,不过小木虫上的其他人是这么做的。没有用过mutiwfn,不知道mutiwfn做出来的图什么样,不过根据我做过的ESP的图来看,楼 ...

哦,谢谢了,用multiwfn其实也可以生成cube文件然后用GV处理,我试一下谢谢啦
9楼2013-01-15 16:22:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

兔子lizzy

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by mu00mu8 at 2013-01-13 23:08:18
使用Gaussian完成计算,保存*.chk文件;
用GaussView打开*.chk,从Results中选Surfaces,打开Surfaces and Cubes对话框,选取Cube Actions中的New Cube,从Kind中选取Total Density,然后点OK。选取Surface Action ...

  请问算ESP有什么用途呀?
10楼2013-01-15 22:32:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 兔子lizzy 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 岩土工程学报什么时候才能终审完呐 25+3 yeager111 2026-08-10 4/200 2026-08-16 20:42 by tfang
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +11 家与远方 2026-08-10 16/800 2026-08-16 10:28 by ray43
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
请填处理意见