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汕头大学海洋科学接受调剂
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luyang_982

新虫 (小有名气)

[求助] 新手求助 高人请进 二面角和扭转角

我用gaussian优化好了一个结构,想把二面角和实验值做下比较。
但文献给出的是扭转角,而且看到书里说: 二面角=180-扭转角的绝对值
如果文献给出的是原子顺序为1234的扭转角,那我在gaussview上看相应的二面角时,是否也要按1234的顺序点呢?
但我得到的二面角好像和扭转角是一样的呢,就是正负号不同?不是互补的关系呢?
另外书里说二面角都是正的,但我在gaussview上看也有负的呢,怎么回事?
跪求高人指点啊!!!!!!
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原来是梦8804

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
luyang_982: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-01-11 18:20:31
引用回帖:
3楼: Originally posted by luyang_982 at 2013-01-11 14:17:16
多谢回复,我明白了在软件里这两个角是一样的。

按你说的:二面角指的是123平面和234平面的二面角,沿着23的轴看过去,1号原子在4号原子的逆时针方向(左手边),则取正值。
我看书上说扭转角:原子1顺时针转到 ...

如果文献中也是按照此规则定义的扭转角,应该与gaussviw没差别才对。我想要么是文献里定义反了,要么是gaussview里的4号原子放反了。
4楼2013-01-11 15:39:00
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原来是梦8804

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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luyang_982: 金币+3, ★★★★★最佳答案 2013-01-11 18:20:18
要是拿数学里面的二面角的概念,范围就是[0,180];软件里的二面角有正负是得考虑4号原子在123号原子平面的哪一侧,举MS里二面角的来说,按顺序点1234共4个原子,二面角指的是123平面和234平面的二面角,沿着23的轴看过去,1号原子在4号原子的逆时针方向(左手边),则取正值,反之取负值;绝对值仍在[0,180]。
扭转角也可以理解成二面角啊,或者说在软件里两者概念是一样的。你说的书里看到的,二面角都是数学概念里的二面角,扭转角就成了软件里的二面角了。
2楼2013-01-11 00:21:19
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luyang_982

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 原来是梦8804 at 2013-01-11 00:21:19
要是拿数学里面的二面角的概念,范围就是;软件里的二面角有正负是得考虑4号原子在123号原子平面的哪一侧,举MS里二面角的来说,按顺序点1234共4个原子,二面角指的是123平面和234平面的二面角,沿着23的轴看过去, ...

多谢回复,我明白了在软件里这两个角是一样的。

按你说的:二面角指的是123平面和234平面的二面角,沿着23的轴看过去,1号原子在4号原子的逆时针方向(左手边),则取正值。
我看书上说扭转角:原子1顺时针转到与原子4重合时的角度为正。这样看来这两个的正负应该是一致的。但我在gaussview上得到的二面角与实验值扭角角度相同而正负号正好相反是为什么呢?我在比较时可直接忽略正负号吗?
3楼2013-01-11 14:17:16
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