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luyang_982新虫 (小有名气)
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[求助]
新手求助 高人请进 二面角和扭转角
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我用gaussian优化好了一个结构,想把二面角和实验值做下比较。 但文献给出的是扭转角,而且看到书里说: 二面角=180-扭转角的绝对值 如果文献给出的是原子顺序为1234的扭转角,那我在gaussview上看相应的二面角时,是否也要按1234的顺序点呢? 但我得到的二面角好像和扭转角是一样的呢,就是正负号不同?不是互补的关系呢? 另外书里说二面角都是正的,但我在gaussview上看也有负的呢,怎么回事? 跪求高人指点啊!!!!!! |
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【答案】应助回帖
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luyang_982: 金币+3, ★★★★★最佳答案 2013-01-11 18:20:18
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luyang_982: 金币+3, ★★★★★最佳答案 2013-01-11 18:20:18
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要是拿数学里面的二面角的概念,范围就是[0,180];软件里的二面角有正负是得考虑4号原子在123号原子平面的哪一侧,举MS里二面角的来说,按顺序点1234共4个原子,二面角指的是123平面和234平面的二面角,沿着23的轴看过去,1号原子在4号原子的逆时针方向(左手边),则取正值,反之取负值;绝对值仍在[0,180]。 扭转角也可以理解成二面角啊,或者说在软件里两者概念是一样的。你说的书里看到的,二面角都是数学概念里的二面角,扭转角就成了软件里的二面角了。 |
2楼2013-01-11 00:21:19
luyang_982
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